| 葡萄BBX基因家族的鉴定与表达分析 |
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| 引用本文： | 葛孟清,刘众杰,朱旭东,卢素文,管乐,房经贵.葡萄BBX基因家族的鉴定与表达分析[J].核农学报,2021,35(1):18-30. |
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| 作者姓名： | 葛孟清 刘众杰 朱旭东 卢素文 管乐 房经贵 |
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| 作者单位： | 南京农业大学园艺学院,江苏南京210095;南京农业大学园艺学院,江苏南京210095;南京农业大学园艺学院,江苏南京210095;南京农业大学园艺学院,江苏南京210095;南京农业大学园艺学院,江苏南京210095;南京农业大学园艺学院,江苏南京210095 |
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| 基金项目： | 江苏现代农业(葡萄)产业技术体系建设项目(JATS[2018]279);江苏省农业科技自主创新项目(CX(18)2008)。 |
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| 摘 要： | BBX转录因子家族参与植物幼苗的光形态建成、开花、光周期调控及避荫反应等,在高等植物的生长发育过程中起到重要作用。为了解葡萄中BBX基因家族功能,本研究利用生物信息学方法对葡萄BBX基因家族成员的数量、结构、启动子、氨基酸特性、染色体定位及基因进化进行分析。结果表明,葡萄BBX家族有25个成员,以酸性蛋白为主;亚细胞定位表明,有4个分泌途径信号肽,VvBBX2、VvBBX5、VvBBX7、VvBBX20;有2个叶绿体转运肽,VvBBX23、VvBBX24;有1个线粒体靶向肽VvBBX1。染色体定位分析发现,25个VvBBXs基因主要分布在1、3、4、5、7、9、11、12、14、18、19共11条染色体上;系统发育进化分析发现葡萄BBX家族成员分为5个亚家族;葡萄与拟南芥的同源性分析发现,葡萄BBX蛋白家族有很强的保守性;在葡萄BBX基因启动子序列中含有光相应元件、激素类响应元件、低温响应元件等多种顺式作用元件。葡萄BBX基因家族在不同发育时期不同葡萄组织中的表达谱显示,该基因家族具有一定时空表达特异性;不同光照条件下,葡萄BBX基因的相对表达量有显著变化,这表明葡萄BBX基因家族与光形态建成及光合作用有着密切的关系。本研究结果为葡萄BBX基因家族的进一步功能分析提供了重要研究基础。
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| 关 键 词： | 葡萄 BBX转录因子 生物信息学 光形态建成 光质 |
| 收稿时间： | 2019-06-24 |
Bioinformatics Identification and Analysis of BBX Gene Family in Grape |
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| GE Mengqing,LIU Zhongjie,ZHU Xudong,LU Suwen,GUAN Le,FANG Jinggui.Bioinformatics Identification and Analysis of BBX Gene Family in Grape[J].Acta Agriculturae Nucleatae Sinica,2021,35(1):18-30. |
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| Authors: | GE Mengqing LIU Zhongjie ZHU Xudong LU Suwen GUAN Le FANG Jinggui |
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| Institution: | College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, Jiangsu 210095 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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