砂糖桔全长cDNA 文库的构建及病程
相关蛋白基因的克隆与分析 |
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引用本文: | 胡亚平,郭雁君,吉前华,蒋 惠,郭丽英,张小凤,周希琴.砂糖桔全长cDNA 文库的构建及病程
相关蛋白基因的克隆与分析[J].广东农业科学,2015,42(16):89-88. |
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作者姓名: | 胡亚平 郭雁君 吉前华 蒋 惠 郭丽英 张小凤 周希琴 |
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作者单位: | 肇庆学院果树研究所/ 肇庆学院生命科学学院,广东 肇庆 526061 |
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基金项目: | 肇庆学院自然科学基金(201103);肇庆
学院科研创新团队项目(201205) |
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摘 要: | 为从分子水平上了解影响砂糖桔生理代谢、生长发育、病虫害抗性和品质的众多基因,以无籽砂糖桔幼叶为材料,应用SMART技术构建了cDNA文库,检测文库发现其库容量达到1.36×106,重组率为95%,插入片段绝大多数分布在0.6~2kb之间,有36%的插入片段是全长cDNA。随机挑选224个克隆进行测序,获得了1个病程相关蛋白基因的全长cDNA序列。将基因序列提交Gen Bank,编号为KJ000019。基因的CDS长429bp,5′UTR为43bp,3′UTR为235bp,编码长度为143个氨基酸残基的蛋白。基因位于第8染色体上,有1个长度为193bp的内含子,基因编码的蛋白质分子量为15.4ku,等电点为6.96。该蛋白N端含有长度约为22aa的信号肽序列,指导蛋白分泌到细胞外;剩余部分是一个典型的Barwin保守结构域,具有几丁质酶的活性,在受到细菌、真菌侵染时可以分解部分真菌和细菌的细胞壁,发挥抗病作用。
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关 键 词: | 砂糖桔 cDNA 文库 病程相关蛋白 |
Construction of a full-length cDNA library of Shatangju
and cloning of pathogenesis-related protein gene |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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