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胸膜肺炎放线杆菌血清8型自转运黏附素基因的克隆测序及功能预测分析
引用本文:王瑜,雷连成,陈创夫,韩文瑜,谢芳,周靓,邢艳苹,杨舒心,何伯萍.胸膜肺炎放线杆菌血清8型自转运黏附素基因的克隆测序及功能预测分析[J].中国预防兽医学报,2011,33(4).
作者姓名:王瑜  雷连成  陈创夫  韩文瑜  谢芳  周靓  邢艳苹  杨舒心  何伯萍
作者单位:1. 石河子大学动物科学院,新疆石河子832003;吉林大学畜牧兽医学院,吉林长春130062
2. 吉林大学畜牧兽医学院,吉林长春,130062
3. 石河子大学动物科学院,新疆石河子,832003
基金项目:国家自然科学基金项目,吉林大学
摘    要:为研究胸膜肺炎放线杆菌(APP)三聚体自转运黏附素(TAAs)的功能,以GenBank登录的APP血清5b型自转运黏附素基因5'端的3875bp序列设计引物,通过PCR的方法首次获得APP血清8型运黏附素N端的基因序列片段,测序结果与已知血清型的基因序列和氨基酸推导序列分别进行比对,结果表明与血清7型自转运黏附素N端同源性达到93%,氨基酸推导序列同源性达到97%;与血清5b型自转运黏附素N端同源性达到92%,氨基酸推导序列同源达到100%.经软件分析获得的序列含有与细菌的黏附、聚集和侵入密切相关的Hep_Hag基序,应用马克斯-普朗克研究所的在线分析TAAs的基序和蛋白域的软件daTAA,进行预测并证明所得序列为TAAs,并且具有完整的N段头部序列,有重要功能区具有良好的抗原性.比对的结果为寻找研究APP的定植基序和毒力因素提供了重要基础.

关 键 词:胸膜肺炎放线杆菌  三聚体自转运黏附素

Sequencing and functional analysis of Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 8 adhesin gene
WANG Yu,LEI Lian-cheng,CHEN Chuang-fu,HAN Wen-yu,XIE Fang,ZHOU Liang,XING Yan-ping,YANG Shu-xin,HE Bo-ping.Sequencing and functional analysis of Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 8 adhesin gene[J].Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine,2011,33(4).
Authors:WANG Yu  LEI Lian-cheng  CHEN Chuang-fu  HAN Wen-yu  XIE Fang  ZHOU Liang  XING Yan-ping  YANG Shu-xin  HE Bo-ping
Institution:WANG Yu1,2,LEI Lian-cheng2*,CHEN Chuang-fu1,HAN Wen-yu2,XIE Fang2,ZHOU Liang2,XING Yan-ping2,YANG Shu-xin2,HE Bo-ping2 (1. College of Animal Science and Technology,Shihezi University,Xinjiang 832003,China,2. College of Animal Science and Veterinary,Jilin University,Changchun 130062,China)
Abstract:Adhesion is an important pathogenic process for the pathogenesis of bacteria. To study the function of Actinobacillus pleuropneumoniae (APP) autotransporter adhesins (TAAs), the sequence encoding N part of APP serotype 8 TAAs was amplified by PCR with the primers designed based on the APP serotype 5b transshipment adhesion element gene of 3,875 bp sequence (5' end CP000569.1). The sequence was analyzed by software SMART and PFAM which indicated that the sequence contained Hep_Hag base domain, which was clos...
Keywords:PCR  Hep_Hag
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