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灵芝尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因 的电子克隆与生物信息学分析
引用本文:贺望兴,杨普香,李延升,石旭平,黎小萍,张贱根,蔡海兰,蔡翔.灵芝尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因 的电子克隆与生物信息学分析[J].江西农业学报,2019,31(9).
作者姓名:贺望兴  杨普香  李延升  石旭平  黎小萍  张贱根  蔡海兰  蔡翔
作者单位:江西省蚕桑茶叶研究所,江西 南昌,330203;江西省蚕桑茶叶研究所,江西 南昌,330203;江西省蚕桑茶叶研究所,江西 南昌,330203;江西省蚕桑茶叶研究所,江西 南昌,330203;江西省蚕桑茶叶研究所,江西 南昌,330203;江西省蚕桑茶叶研究所,江西 南昌,330203;江西省蚕桑茶叶研究所,江西 南昌,330203;江西省蚕桑茶叶研究所,江西 南昌,330203
基金项目:江西省科技厅重点研发计划"茶枝食用菌化应用研究"
摘    要:尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UGPase)是灵芝多糖合成途径的关键酶,用电子克隆方法得到灵芝UGPase基因,并利用生物信息学软件对UGPase基因编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、亲/疏水性、信号肽、蛋白结构域、蛋白高级结构以及系统进化树的构建等方面进行了预测和分析。结果表明:UGPase基因全长1691 bp,包含一个1515 bp的完整开放阅读框,编码504个氨基酸;该蛋白不存在信号肽和跨膜结构域,它是定位于细胞质内的一种亲水性稳定蛋白酶;它的高级结构主要是由α螺旋结构和无规则卷曲结构所组成;同源比对分析显示,该酶基因编码的氨基酸序列和其他动植物的UGPase酶相比在序列组成、高级结构方面具有一定的相似性。

关 键 词:灵芝  尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶  电子克隆  生物信息学

Silico Cloning and Characterization Analysis of UDP Glucose Pyrophosphorylase Gene from Ganoderma lucidum by Bioinformatics
Abstract:
Keywords:
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