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不同光照周期下黄鳝不同组织DNA甲基化的MSAP分析
引用本文:魏国华,曹哲明,丁炜东,邴旭文.不同光照周期下黄鳝不同组织DNA甲基化的MSAP分析[J].华中农业大学学报,2015,34(6):101-107.
作者姓名:魏国华  曹哲明  丁炜东  邴旭文
作者单位:南京农业大学无锡渔业学院,无锡 214128;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,无锡 214081;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,无锡 214081;南京农业大学无锡渔业学院,无锡 214128;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,无锡 214081
基金项目:江苏省科技支撑计划─农业部分项目(BE2013315); 江苏省自然科学基金项目(BK2011184); 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2015JBFM06)
摘    要:为研究光照周期对黄鳝不同组织的基因组DNA甲基化的影响,设置3个不同的光照时间(8、10和12h)处理,对黄鳝心、肝、脾、肾、肠、肌肉和脑等组织基因组DNA甲基化用甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplified polymorphism,MSAP)技术进行分析。结果显示,不同组织基因组DNA对光照时间有不同的反应。其中,肌肉基因组DNA甲基化对光照周期的变化较为敏感,不同光照周期下肌肉基因组DNA总甲基化差异显著,光照周期为12h半甲基化和其他处理相比差异也很显著;肾脏和脑的基因组DNA甲基化对光照周期变化最不敏感,各处理组之间全甲基化、半甲基化和总甲基化差异都不显著;肝脏、肠、脾和心脏表现比较复杂,其中肝脏不同处理下基因组DNA半甲基化和总甲基化差异都不显著,光照周期为8h时,全甲基化差异显著;肠不同处理下基因组DNA全甲基化、半甲基化差异不显著,在光照周期为10h的处理组的总甲基化和其他处理组差异显著;脾脏在光照周期为10h和8h时全甲基化和总甲基化各处理组差异显著,在光照周期为12h时半甲基化和其他处理组差异显著;心脏在光照周期为10h时半甲基化和其他处理组差异显著。

关 键 词:黄鳝    DNA甲基化    甲基化敏感扩增多态性    光照周期
收稿时间:2015/4/21 0:00:00
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