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| 兰州鲇（CAG）n、（GATA）n微卫星文库构建与鉴定 | |
| 引用本文： | 魏大为,连总强,吴旭东,张利平,肖伟,赛清云,王发新.兰州鲇（CAG）n、（GATA）n微卫星文库构建与鉴定[J].淡水渔业,2014(5). |
| 作者姓名： | 魏大为 连总强 吴旭东 张利平 肖伟 赛清云 王发新 |
| 作者单位： | 1. 甘肃农业大学动物科学技术学院，兰州 730070; 宁夏回族自治区水产研究所，银川 750001; 宁夏渔业工程技术研究中心，银川 750001 2. 甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州,730070 3. 宁夏回族自治区水产研究所，银川 750001; 宁夏渔业工程技术研究中心，银川 750001 4. 甘肃农业大学动物科学技术学院，兰州 730070; 宁夏渔业工程技术研究中心，银川 750001 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31360633)；国家科技支撑计划项目 |
| 摘 要： | 应用磁珠富集法构建兰州鲇（ Silurus lanzhouensis） CAG重复和GATA重复的微卫星文库，并分析其序列特征。兰州鲇基因组DNA经MseI酶切，选取200～800 bp的片段与生物素标记的探针（CAG）8和（GATA）6杂交，捕获到含有微卫星序列的目的DNA片段连接到pMD19-T载体，转化到大肠杆菌DH5α菌株中构建微卫星富集文库，经PCR检测筛选出阳性克隆进行测序。从126个阳性克隆中随机选取96个进行测序，获得59个微卫星序列（ GenBank登录号： KJ545973～KJ545998， KJ598088～KJ598120）。其中完美型31个（52.54％）、非完美型20个（33.9％）、混合型为8个（13.56％）。根据侧翼序列，成功设计48对引物，选取25对微卫星引物在10个个体进行扩增与多态性筛选，共获得10对多态性引物。结果表明，经优化的磁珠富集法能够高效地获得兰州鲇微卫星标记，这些标记将为兰州鲇种质资源保护、微卫星连锁图谱构建、经济性状的QTL定位及分子标记辅助选育奠定基础。 |
| 关 键 词： | 兰州鲇(Silurus lanzhouensis) 磁珠富集 微卫星 |
Construction and identification of (CAG) n and (GATA) n microsatellites from the Silurus lanzhouensis genome |
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| WEI Da-wei,LIAN Zong-qiang,WU Xu-dong,ZHANG Li-ping,XIAO-Wei,SAI Qing-yun,WANG Fa-xin.Construction and identification of (CAG) n and (GATA) n microsatellites from the Silurus lanzhouensis genome[J].Freshwater Fisheries,2014(5). | |
| Authors: | WEI Da-wei LIAN Zong-qiang WU Xu-dong ZHANG Li-ping XIAO-Wei SAI Qing-yun WANG Fa-xin |
| Abstract: | |
| Keywords: | Silurus lanzhouensis magnetic bead enrichment microsatellites |
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