葡萄VvGCN5基因的鉴定及互作蛋白筛选 |
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引用本文: | 陈雪琴,庞倩倩,裴丹,任艳华,房经贵.葡萄VvGCN5基因的鉴定及互作蛋白筛选[J].南京农业大学学报,2023(5):852-861. |
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作者姓名: | 陈雪琴 庞倩倩 裴丹 任艳华 房经贵 |
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作者单位: | 南京农业大学园艺学院 |
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基金项目: | 国家重点研发计划项目(2019YFD1001904);;国家自然科学基金项目(31901991);;江苏省自然科学基金项目(BK20190529);;江苏省农业科技自主创新资金项目[CX(21)3023]; |
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摘 要: | 目的]本文旨在揭示组蛋白乙酰转移酶GCN5(general control non-repressible 5)在葡萄生长发育过程中的调控机制,并筛选出与VvGCN5互作的蛋白,以期为进一步构建VvGCN5在葡萄生长发育中的调控网络提供理论基础。方法]利用生物信息学技术对VvGCN5的蛋白二级结构、基因结构、功能域、启动子的顺式作用元件以及抗逆的表达量和时空表达进行分析,并在烟草中进行亚细胞定位,研究VvGCN5表达位置。通过酵母双杂交技术筛选与VvGCN5互作的蛋白,并通过双分子荧光互补(BIFC)技术进行验证。结果]VvGCN5的二级结构由α-螺旋、延伸链、β-折叠以及无规则卷曲构成,含有10段内含子序列和11段CDS序列,具有Acetyltransf_1和Bromodomain结构域,以及ARE、GT1-motif、TGACG-motif、CAT-box、CGTCA-motif等顺式作用元件。通过查询GEO数据库发现VvGCN5可能受到光照和灰霉病的影响。VvGCN5主要表达于葡萄的成熟茎、萌芽初期、心皮、种子中。亚细胞定位发现VvGCN5位于细胞核和细胞膜上。此外,以pG...
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关 键 词: | 葡萄 VvGCN5 酵母双杂交技术 双分子荧光互补 生物信息学分析 |
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