中华虎头蟹线粒体16S rRNA和 COⅠ基因的序列比较及其系统进化分析 |
| |
引用本文: | 刘 萍,段亚飞,毛智超,李吉涛,高保全,李 健.中华虎头蟹线粒体16S rRNA和 COⅠ基因的序列比较及其系统进化分析[J].水产学报,2013,37(10):1441-1451. |
| |
作者姓名: | 刘 萍 段亚飞 毛智超 李吉涛 高保全 李 健 |
| |
作者单位: | 中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室;中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室;中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室;中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室;中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室;中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 |
| |
基金项目: | 国家“八六三”高技术研究发展计划(2012AA10A409);山东省科技发展计划项目(2011GHY11526) |
| |
摘 要: | 为研究中华虎头蟹野生群体的种质资源及遗传多样性状况,采用PCR扩增获得中华虎头蟹线粒体DNA的16S rRNA和COⅠ基因片段,分别对其进行序列比较及系统进化分析。16S rRNA和COⅠ基因片段的A+T平均含量分别为67.7%和61.4%,A+T含量显著高于G+C含量。长度为515 bp的16S rRNA基因片段共检测出单倍型4种,多态性位点4个,均为单一变异位点;长度为653 bp的COⅠ基因片段共检测出单倍型11种,多态性位点23个,其中简约信息位点5个和单一变异位点18个。COⅠ基因片段比16S rRNA基因片段具有较大的变异,更适于中华虎头蟹种群的遗传多样性分析。基于16S rRNA和COⅠ基因片段的遗传距离与系统进化分析结果一致,表明中华虎头蟹与梭子蟹科的蟹类亲缘关系最近,方蟹科与沙蟹科的蟹类聚为一支,与传统分类结果基本一致;而脊椎动物2个基因片段的系统进化分析结果不一致。根据16S rRNA基因片段的遗传距离推测出4科7种蟹的大致分化时间发生在古新世至始新世。
|
关 键 词: | 中华虎头蟹 线粒体DNA 16S rRNA基因 COⅠ基因 序列分析 |
收稿时间: | 6/9/2013 12:00:00 AM |
修稿时间: | 2013/8/27 0:00:00 |
本文献已被 CNKI 等数据库收录! |
| 点击此处可从《水产学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《水产学报》下载免费的PDF全文 |
|