| 灵芝漆酶注释基因Lacc1的生物信息学分析及其Cu2+诱导表达 |
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| 引用本文： | 陈岳文,康信聪,熊兴耀,刘东波.灵芝漆酶注释基因Lacc1的生物信息学分析及其Cu2+诱导表达[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2013,39(3):265-269. |
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| 作者姓名： | 陈岳文 康信聪 熊兴耀 刘东波 |
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| 作者单位： | 湖南省作物种质资源创新与利用重点实验室，湖南农业大学园艺园林学院，国家中医药管理局亚健康实验室，,湖南省作物种质资源创新与利用重点实验室，国家中医药管理局亚健康实验室，,湖南省作物种质资源创新与利用重点实验室,湖南省作物种质资源创新与利用重点实验室，湖南农业大学园艺园林学院，国家中医药管理局亚健康实验室， |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划（973计划）,国家农业成果转化资金项目 |
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| 摘 要： | 为验证Lacc1基因的功能，揭示灵芝漆酶基因及其启动子结构与其转录表达的内在关系，预测了Lacc1的氨基酸序列结构及灵芝漆酶注释基因Lacc1的上游启动子区域，研究已测序的菌株——灵芝P9在Cu2+诱导条件下漆酶基因Lacc1的表达情况。Protein Blast分析结果表明，Lacc1含有3个铜氧化酶(Cu–oxidase)保守结构域，与Polyporus ciliatus漆酶lcc3–3的相似性最高，为71%，并具有高度保守的漆酶特征序列L1–L4；亚细胞位置和信号肽预测结果表明，Lacc1含有信号肽，且为胞外分泌酶；Lacc1基因上游启动子区域包含1个TATA box、3个金属响应元件(MRE)、5个氮因子结合位点(NIT2)、1个压力响应元件(STRE)；在150 μmol/L Cu2+的诱导下，Lacc1基因的表达在第6、8、10和14天分别上调了2.8、4.9、1.6和1.9倍，通过对Lacc1的启动子结构和诱导表达分析，推测灵芝漆酶注释基因Lacc1的诱导表达特性与启动子区域的金属响应元件等调控位点具有极大相关性。
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| 关 键 词： | 灵芝 漆酶 生物信息学分析 Cu2+诱导表达 |
| 收稿时间： | 2013/3/4 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2013/4/5 0:00:00 |
Bioinformatics analysis of putative laccase gene Lacc1 fromGanoderma lucidum and Cu2+ induced gene expression |
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| Chen yuewen,and Liu dongbo.Bioinformatics analysis of putative laccase gene Lacc1 fromGanoderma lucidum and Cu2+ induced gene expression[J].Journal of Hunan Agricultural University,2013,39(3):265-269. |
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| Authors: | Chen yuewen and Liu dongbo |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Ganoderma lucidum laccase bioinformatics Cu2+ induced expression |
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