| 牛乳头瘤病毒基因2型流行株全基因组的克隆及序列分析 |
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| 引用本文： | 贺志昊,孟庆玲,乔 军,刘昱成,杨海波,王国超,才学鹏,陈创夫.牛乳头瘤病毒基因2型流行株全基因组的克隆及序列分析[J].西北农业学报,2013,22(11):183-188. |
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| 作者姓名： | 贺志昊 孟庆玲 乔 军 刘昱成 杨海波 王国超 才学鹏 陈创夫 |
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| 作者单位： | （1. 石河子大学 动物科技学院，新疆石河子 832003；2. 中国农业科学院 兰州兽医研究所，兰州 730046） |
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| 基金项目： | 农业公益行业专项子课题（201303037 5）；兵团国际科技合作项目（2012BC006）。 |
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| 摘 要： | 为了解牛乳头瘤病毒（Bovine Papillomavirus，BPV）新疆流行株基因型及其基因组遗传变异情况，用乳头瘤病毒L1基因简并引物 FAP59/FAP64对新疆沙湾县奶牛皮肤肿瘤组织样品进行PCR扩增，测序后确定，BPV基因型；设计6对BPV基因型特异性引物，经扩增、测序、拼接后获得BPV流行株全长基因组序列。 L1基因序列分析表明，BPV2 SW01流行株为BPV 2基因型；该毒株基因组全长7 944 bp，包括 E6、E7、E1、E8、E2、E4、E3、E5、L2和 L1 10个开放阅读框（ORF）。遗传进化树分析显示，BPV2 SW01归于Delta乳头瘤病毒属，与BPV 1和BPV 13进化关系最近。
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| 关 键 词： | 牛乳头瘤病毒基因2型 衣壳蛋白L1基因 全基因组序列 遗传进化分析 |
Cloning and Sequence Analysis of the Complete Genome of Epidemic Strains of Bovine papillomavirus Type 2 |
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| HE Zhihao,MENG Qingling,QIAO Jun,LIU Yucheng,YANG Haibo,WANG Guochao,CAI Xuepeng and CHEN Chuangfu.Cloning and Sequence Analysis of the Complete Genome of Epidemic Strains of Bovine papillomavirus Type 2[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2013,22(11):183-188. |
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| Authors: | HE Zhihao MENG Qingling QIAO Jun LIU Yucheng YANG Haibo WANG Guochao CAI Xuepeng and CHEN Chuangfu |
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| Abstract: | In order to clarify the genotype and better understand variation of genome of the bovine papilloma virus (BPV), DNA extracted from skin tumors of Xinjiang Shawan cow was used as temple to detect PBV infection by PCR using the primer pair of FAP59/FAP64. The amplified fragment was then sequenced, analyzed and genotyped. Based on the genotyping results 6 pairs of specific primers of BPV were designed and used to amplify the genome of BPV epidemic strains. Sequence analysis of L1 gene showed that BPV2 SW01 belonged to the BPV 2 genotype. The genome length was 7 944 bp, including 10 open reading frames (ORFs). Phylogenetic analysis showed that BPV2 SW01 was grouped within the genus Deltapa pillomavirus, which is most closely related to BPV 1 and BPV 13. |
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| Keywords: | BPV2 Capsid protein L1 gene Complete genome sequence Phylogenetic analysis |
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