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梭梭VHA B基因克隆及序列分析
引用本文:杨丽丽,吴明朝,甘晓燕,石 磊,陈虞超,宋玉霞.梭梭VHA B基因克隆及序列分析[J].西北农业学报,2013,22(10):68-74.
作者姓名:杨丽丽  吴明朝  甘晓燕  石 磊  陈虞超  宋玉霞
作者单位:(1.宁夏农业生物技术重点实验室,银川 750002;2.宁夏大学 生命科学学院,银川 750021 )
基金项目:宁夏回族自治区科技攻关项目。
摘    要:采用RT PCR和RACE法从超旱生、耐盐植物梭梭(Haloxylon ammodendron)中扩增出VHA B基因cDNA序列,其开放阅读框为1 413 bp,推测编码全长为471个氨基酸残基的氨基酸序列,该蛋白分子量约为52.304 ku,等电点为5.08。运用SMART、DNAMAN、GOR4、TMPred等生物信息学软件对梭梭VHA B功能域、跨膜结构进行分析显示,梭梭VHA B含有3个ATP synt_ab_N 、ATP synt_ab、ATP synt_ab_C结构域,但是不含跨膜结构域和信号肽。氨基酸序列同源性结果显示,HaVHA B与盐爪爪、盐穗木、碱蓬等同源性高达89.68%。说明VHA B基因是一个高度保守基因。

关 键 词:梭梭  抗逆  VHA  B  序列分析

Cloning and Sequence Analysis of VHA B Genefrom Haloxylon ammodendron
YANG Lili,WU Mingzhao,GAN Xiaoyan,SHI Lei,CHEN Yuchao and SONG Yuxia.Cloning and Sequence Analysis of VHA B Genefrom Haloxylon ammodendron[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2013,22(10):68-74.
Authors:YANG Lili  WU Mingzhao  GAN Xiaoyan  SHI Lei  CHEN Yuchao and SONG Yuxia
Abstract:
Keywords:Haloxylon ammodendron  Stress resistance  VHA B  Sequence analysis
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