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玉米大斑病病菌对热带玉米种质CML493的DNA甲基化变异与mRNA表达分析
引用本文:李春雷,苏桂华,张辰,孙伟峰,祁新,苏义臣.玉米大斑病病菌对热带玉米种质CML493的DNA甲基化变异与mRNA表达分析[J].玉米科学,2020,28(6):52-58.
作者姓名:李春雷  苏桂华  张辰  孙伟峰  祁新  苏义臣
作者单位:吉林省农业科学院玉米研究所/玉米国家工程实验室(长春), 吉林 公主岭 136100;吉林农业大学农学院, 长春 130118
基金项目:吉林省科学技术厅项目(172392GG010035672)、吉林省农业科技创新工程项目、吉林省农业农村厅高产优质特色玉米主导品种鉴评及示范推广项目
摘    要:以热带高抗大斑病玉米种质CML493幼苗为试验材料,采用人工接种大斑病病菌处理,采用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术和转录组测序(mRNA-seq)技术,对经过接种大斑病病菌处理不同时间的CML493基因组DNA胞嘧啶甲基化进行DNA甲基化模式、DNA甲基化水平分析和mRNA表达分析。结果表明,接种大斑病病菌6、12 d的甲基化敏感扩增多态性分别为78.21%和76.13%,甲基化敏感扩增单态性分别为21.79%和23.87%。接种大斑病病菌6 d时,总甲基化率上升5.49%,全甲基化率上升14.24%,半甲基化率上升6.11%。接种大斑病病菌12 d时,总甲基化率上升6.40%,全甲基化率上升16.73%,半甲基化率上升5.57%。接种大斑病病菌0、6、12 d共检测到2 298个共表达基因,共检测到1 434个共表达上调基因,检测到769个共表达下调基因,上调基因数目显著多于下调基因数目。

关 键 词:玉米  大斑病病菌  DNA甲基化  mRNA表达
收稿时间:2019/11/19 0:00:00

DNA Methylation Variation and mRNA Expression Analysis of Tropical Maize Germplasm CML493 after Artificial Inocuting Setosphaeria turcica
LI Chun-lei,SU Gui-hu,ZHANG Chen,SUN Wei-feng,QI Xin,SU Yi-chen.DNA Methylation Variation and mRNA Expression Analysis of Tropical Maize Germplasm CML493 after Artificial Inocuting Setosphaeria turcica[J].Journal of Maize Sciences,2020,28(6):52-58.
Authors:LI Chun-lei  SU Gui-hu  ZHANG Chen  SUN Wei-feng  QI Xin  SU Yi-chen
Institution:Maize Research Institute, Jilin Academy of Agricultural Sciences/National Engineering Laboratory for Maize, Gongzhuling 136100;College of Agriculture, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China
Abstract:
Keywords:Maize(Zea may L)  Setosphaeria turcica  DNA methylation  mRNA expression
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