| 基于SNP标记的糯玉米种质资源遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 卢媛,韩晴,艾为大,施标,王义发,潘春丹,沈雪芳.基于SNP标记的糯玉米种质资源遗传多样性分析[J].玉米科学,2020,28(3):44-51. |
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| 作者姓名： | 卢媛 韩晴 艾为大 施标 王义发 潘春丹 沈雪芳 |
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| 作者单位： | 上海市农业科学院作物育种栽培研究所, 上海 201403;CIMMYT-中国特用玉米研究中心, 上海 201403;安顺学院农学院, 贵州 安顺 561000;上海市浦东新区农业技术推广中心, 上海 201201 |
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| 基金项目： | 上海市种业发展项目[沪农科种字（2016）第1-3号]、上海市科学技术委员会科研计划项目（153919N1300，17391900100，17391902702）、上海市农业科学院卓越团队项目（农科创2017B-08）、上海市市级农口系统青年人才成长计划[沪农青字（2015）第1-4号]、上海市市级农口系统青年人才成长计划[沪农青字（2018）第1-6号]、2019上海市农业科学院青年科技人员“助跑”计划 |
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| 摘 要： | 为了提高糯玉米种质资源的利用效率,挖掘优异糯玉米种质资源、改良糯玉米品种,利用(Single nucleotide polymorphism,SNP)芯片技术对44份不同来源的糯玉米自交系和5份分别代表中国玉米5大类群的普通玉米自交系进行全基因组扫描。结果表明,34 257个SNP标记在49份玉米自交系中的多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.02～0.56,平均含量为0.32;最小等位基因频率(minor allele frequency,MAF)≥0.03。49份玉米自交系间的状态一致性(identity-by-state,IBS)变幅为0.59～0.99,平均为0.68。基于IBS利用Neighbor-joining(NJ)聚类分析方法,将49份自交系划分为5个类群,分别包含19份、9份、4份、9份和3份材料,其中系谱来源不清晰的糯玉米自交系被划分至不同类群,明确了它们的亲缘关系。
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| 关 键 词： | 糯玉米 SNP标记 遗传多样性 |
| 收稿时间： | 2019/7/17 0:00:00 |
Genetic Diversity of Waxy Maize Germplasm Revealed by SNP-Chips |
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| LU Yuan,HAN Qing,AI Wei-d,SHI Biao,WANG Yi-f,PAN Chun-dan,SHEN Xue-fang.Genetic Diversity of Waxy Maize Germplasm Revealed by SNP-Chips[J].Journal of Maize Sciences,2020,28(3):44-51. |
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| Authors: | LU Yuan HAN Qing AI Wei-d SHI Biao WANG Yi-f PAN Chun-dan SHEN Xue-fang |
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| Institution: | Crop Breeding and Cultivation Research Institute, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201403;CIMMYT-China Specialty Maize Research Center, Shanghai 201403;College of Agriculture, Anshun University, Anshun 561000;Agricultural Generalize Center, Shanghai 201201, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Waxy maize SNP marker Genetic diversity |
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