| 浙江及周边地区猪流行性腹泻病毒S基因分子特征分析 |
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| 引用本文： | 单颖,刘子琦,施杏芬,李国炜,陈聪,罗浩,刘亚杰,方维焕,李肖梁.浙江及周边地区猪流行性腹泻病毒S基因分子特征分析[J].浙江大学学报(农业与生命科学版),2018(5). |
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| 作者姓名： | 单颖 刘子琦 施杏芬 李国炜 陈聪 罗浩 刘亚杰 方维焕 李肖梁 |
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| 作者单位： | 浙江大学动物科学学院浙江省动物预防医学重点实验室;浙江省畜产品质量安全检测中心 |
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| 摘 要： | 对2013年4月至2017年4月间浙江省及周边24个地区共282份病料进行猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)、轮状病毒A型(porcine group A rotavirus, GARV)、猪δ冠状病毒(porcine deltacoronavirus, PDCo V)和猪传染性胃肠炎病毒(porcine transmissible gastroenteritis virus, TGEV)等病原的检测,并选取其中的16份PEDV阳性样品进行S基因克隆和序列分析。结果显示:PEDV的检出率为64.89%(183/282),GARV为0.35%(1/282),PDCo V为4.25%(12/282),而未检出TGEV;PEDV在11月1日至次年4月1日间的累计检出率为74%,其余时间段的累计检出率为26%。对PEDV的S蛋白进行分子演化分析表明,PEDV可分为3个群,其中16份阳性样品均位于Ⅲ群,与疫苗毒株CV777、SM98和DR13株相比,核苷酸同源性为93.6%～95.2%,氨基酸同源性为92.4%～94.9%。16份PEDV阳性样品与中国PEDV的CV777疫苗毒株相比,形成了3个新的N-糖基化位点,破坏了1个N-糖基化位点。综上表明,当前仔猪腹泻主要病原为PEDV变异株,防控猪流行性腹泻需要注意季节的变化,也需要加快流行株疫苗的开发。
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