4株PRRSV GP5蛋白编码序列的序列测定和特性分析 |
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引用本文: | 秦宏阳,曹宗喜,汤国凯,张得玉,于淼,孔维立,张桂红.4株PRRSV GP5蛋白编码序列的序列测定和特性分析[J].广东畜牧兽医科技,2008,33(5). |
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作者姓名: | 秦宏阳 曹宗喜 汤国凯 张得玉 于淼 孔维立 张桂红 |
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作者单位: | 1. 华南农业大学兽医学院,广东,广州,510642 2. 江门市新会区畜牧局,广东,江门,529100 |
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基金项目: | 国家高技术研究发展计划(863计划),国家生猪现代农业产业技术体系项目,广东省农业类计划项目 |
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摘 要: | 针对PRRSV ORF5基因组设计了1对特异性引物,利用RT-PCR的方法,对在南方地区分离的4株PRRSV ORF5基因进行了基因扩增,克隆到pMD18-T载体后测序,获得了4株PRRSV ORF5基因全长603bp的核苷酸序列。利用生物信息学软件对4株PRRSV ORF5基因序列进行了遗传进化分析,结果显示GD1、GD2、GD3、GD4株与美洲型参考株(VR-2332)的核苷酸序列同源性分别为87.1%、87.2%、87.1%和86.9%。利用系统进化树分析表明GD1、GD2、GD3、GD4株均属于美洲型。进一步采用序列分析软件对病毒结构蛋白推导糖基化位点比较,结果表明不同毒株GP5糖基化位点在基序和位置上均有所不同,这可能与毒株的毒力、免疫原性的差异相关,这些为更好地了解PRRSV的分子流行病学特征和抗原变异规律提供依据,同时为研制基因工程疫苗奠定了基础。
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关 键 词: | 猪繁殖与呼吸综合征 GP5蛋白 序列测定 特性分析 |
Sequencing and analysis of four PRRSV strains' GP5 proteins |
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