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陕北枣品种群遗传结构的SSR分析
引用本文:殷 晓,张春梅,李新岗,等.陕北枣品种群遗传结构的SSR分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2014,42(6):152-160,167.
作者姓名:殷 晓  张春梅  李新岗  
作者单位:西北农林科技大学 林学院 陕西省林业综合重点实验室;西北农林科技大学 林学院 陕西省林业综合重点实验室;西北农林科技大学 林学院 陕西省林业综合重点实验室
基金项目:国家林业公益性行业科研专项(201304110);国家“十二五”林业科技支撑项目(2013BAD14B03)
摘    要:【目的】在分子水平上研究陕北枣品种群遗传结构,揭示品种群分化与品种间的亲缘关系。【方法】选取陕北4个区域(县)8个枣品种群的54份种质叶片为材料,采用7对SSR引物,研究品种群的遗传结构。【结果】基于4个地理区域的枣种质平均观测杂合度(Ho,0.909)大于平均期望杂合度(He,0.634),平均Shannon’s信息指数(I)为1.141,固定系数与近交系数均为负值;佳县品种的有效等位基因数(Ne)、He和I均最小,延川最大;狗头枣品种群的Ne、He和I均最小。供试枣品种地理区域内变异(97%)和品种群内变异(91%)分别大于地理区域间(3%)和品种群间(9%)的分化;且品种群内变异(91%)小于地理区域内变异(97%)。品种群遗传分化系数(0.136)大于地理区域(0.042),而品种群平均基因流(1.584)小于地理区域(5.653)。在遗传距离为0.13处,地理区域UPGMA聚为2个类群:清涧-米脂-佳县类群和延川类群;在遗传距离0.99处,品种群UPGMA聚为2个类群:团枣-木枣类群和狗头枣类群。NJ聚类分析将54份枣种质分为2类,延川、清涧和米脂团枣聚在一起,佳县所有枣种质均聚在第Ⅰ类,且各品种群亲缘关系很近;狗头枣品种群与其他品种群亲缘关系较远。【结论】陕北枣属中度杂合,遗传多样性丰富,变异程度较高,近交程度很低。供试枣品种交流频繁,地理区域间遗传分化低,品种群间分化程度高;枣品种遗传关系与地理区域无明显关系,与品种群密切相关。

关 键 词:  品种群  微卫星标记  遗传结构  遗传分化
收稿时间:2013/5/10 0:00:00

SSR analysis on genetic structure of Chinese jujube in North Shaanxi
YIN Xiao,ZHANG Chun-mei and LI Xin-gang,et al.SSR analysis on genetic structure of Chinese jujube in North Shaanxi[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2014,42(6):152-160,167.
Authors:YIN Xiao  ZHANG Chun-mei and LI Xin-gang  
Abstract:
Keywords:Ziziphus jujuba Mill    cultivar groups  microsatellite  genetic structure  genetic differentiation
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