百合未授粉成熟雌蕊转录组测序研究 |
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引用本文: | 蔡晓昂,崔金腾,贾月慧,张克中.百合未授粉成熟雌蕊转录组测序研究[J].中国农学通报,2014,30(22):148-154. |
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作者姓名: | 蔡晓昂 崔金腾 贾月慧 张克中 |
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作者单位: | 1. 北京农学院2. 北京农学院园林学院 |
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基金项目: | 北京市自然科学基金“百合卷瓣组特异种质参与的杂交育种中花粉管定向生长与胚抢救研究” |
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摘 要: | 本研究旨在大量发掘百合雌蕊特异表达基因,为研究百合杂交障碍的分子机制提供依据。利用Illumina高通量测序平台,进行百合未授粉成熟雌蕊转录组测序和数据组装,并对获得的Unigene进行功能注释、分类和代谢通路分析。“干柱头”雌蕊LoP1和“湿柱头”雌蕊LoP2分别获得40792条和39708条Unigene。2个样品的Unigene通过序列拼接,去冗余处理,以及同源转录本聚类,得到44175条All-Unigene。基于NR、NT、Swiss-Prot、GO、KEGG和COG等6个数据库进行相似性比对(E值≤10-5),依次分别有30343、21647、21281、19274、12964和22227个基因被注释。KEGG分析中,19274条AllUnigene被注释到128个代谢通路上。基因分析显示,百合未授粉成熟雌蕊已为授粉受精做好了物质、能量、信号转导以及抗病原等准备工作。
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关 键 词: | 对比分析 对比分析 |
收稿时间: | 2014/2/18 0:00:00 |
修稿时间: | 2014/3/11 0:00:00 |
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