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奥利亚罗非鱼、尼罗罗非鱼MyoD1和MyoD2基因特征及差异
引用本文:卢中华,俞菊华,李红霞,李建林,唐永凯,阮瑞霞,杨光.奥利亚罗非鱼、尼罗罗非鱼MyoD1和MyoD2基因特征及差异[J].中国水产科学,2010,17(5).
作者姓名:卢中华  俞菊华  李红霞  李建林  唐永凯  阮瑞霞  杨光
作者单位:1. 南京农业大学,无锡渔业学院,江苏,无锡,214081
2. 中国水产科学研究院,淡水渔业研究中心,农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室,江苏,无锡,214081
3. 上海海洋大学,水产与生命学院,上海,201306
基金项目:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金,公益性行业(农业)科研专项经费项目,农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室第七期开放课题 
摘    要:采用RT-PCR和RACE法,分离了奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)、尼罗罗非鱼(O.niloticus)MyoD1和MyoD2基因全长cDNA。结果显示,2种罗非鱼MyoD1全长均为1090bp,包括5′非翻译区(UTR)137bp,3′UTR50bp,开放阅读框(ORF)903bp,编码300个氨基酸,其中第110~161个氨基酸为bHLH结构,第233~249个氨基酸为helixIII结构;MyoD2全长均为1478bp,包括5′UTR215bp,3′UTR471bp,ORF792bp,编码263个氨基酸,其中第91~142个氨基酸为bHLH结构,第212~228个氨基酸为helixIII结构。2种罗非鱼MyoD1与其他鱼类MyoD1的相似性为73%~92%;MyoD2与其他鱼类MyoD2的相似性为74%~79%。系统发育树显示,MyoD1和MyoD2分属两支,MyoD1所反映的不同鱼类间的亲缘关系符合传统分类。2种罗非鱼的MyoD1、MyoD2cDNA序列之间只存在个别碱基的差别,而氨基酸序列一致;奥利亚罗非鱼MyoD1的2个内含子均比尼罗罗非鱼的长。根据MyoD1内含子2的差异构建鉴别奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼基因混杂的标记,对形态上典型的15尾奥利亚罗非鱼、18尾尼罗罗非鱼及15尾奥尼罗非鱼Oreochromis aureus(♂)×Oreochromis niloticus(♀)]进行鉴定。结果其中1尾奥利亚罗非鱼中在MyoD1位点混杂了尼罗罗非鱼的基因,尼罗罗非鱼和奥尼罗非鱼则与预期的一致。该研究为选择基因纯合的奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼提供了新的分子手段。

关 键 词:奥利亚罗非鱼  尼罗罗非鱼  MyoD1基因  MyoD2基因  基因特征  基因差异

Characterization and difference analysis of MyoD1 and MyoD2 gene in Oreochromis aureus and Oreochromis niloticus
LU Zhonghua,YU Juhua,LI Hongxia,LI Jianlin,TANG Yongkai,RUAN Ruixia,YANG Guang.Characterization and difference analysis of MyoD1 and MyoD2 gene in Oreochromis aureus and Oreochromis niloticus[J].Journal of Fishery Sciences of China,2010,17(5).
Authors:LU Zhonghua  YU Juhua  LI Hongxia  LI Jianlin  TANG Yongkai  RUAN Ruixia  YANG Guang
Abstract:
Keywords:
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