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基于线粒体 D-loop 区序列的 4 个黄尾鲴养殖群体遗传多样性分析
引用本文:刘士力,陈大伟,郑建波,程 顺,蒋文枰,迟美丽,夏冯博,李 飞.基于线粒体 D-loop 区序列的 4 个黄尾鲴养殖群体遗传多样性分析[J].广东农业科学,2023,50(11):139-145.
作者姓名:刘士力  陈大伟  郑建波  程 顺  蒋文枰  迟美丽  夏冯博  李 飞
作者单位:1. 浙江省淡水水产研究所 / 农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室 / 浙江省淡水水产遗传育种重点实验室,浙江 湖州 313001;2. 上海海洋大学水产与生命学院 / 农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海 201306;3. 湖州师范学院生命科学学院,浙江 湖州 313001
基金项目:浙江省科技厅财政专项(2022CZZX005);国家淡水水产种质资源库长江流域种质资源分库建设项目(2022)
摘    要:【目的】黄尾鲴(Xenocypris davidi)是以腐殖质、有机碎屑为饵料,兼食浮游生物和底栖动物的的淡水经济鱼类,是浙江省自然水域鱼类增殖放流的主要品种之一。了解人工繁育对黄尾鲴遗传多样性的影响,可为自然水域黄尾鲴的增殖放流策略设计和实施提供参考。【方法】对浙江长兴、八里店、双浦和湖南醴陵 4个黄尾鲴养殖群体的线粒体 DNA(mtDNA)D-loop 序列进行 PCR 扩增和测序,通过序列分析研究 4 个群体的遗传多样性。【结果】黄尾鲴线粒体 D-loop 序列长度为 1 038~1 093 bp,碱基 A+T 含量(65.3%)显著高于 C+G含量(34.7%),平均转换 / 颠换比值(TS/TV)为 4.6。在 128 条黄尾鲴的 D-loop 序列中共检测到 101 个变异位点,包括 97 个简约信息位点;界定了 19 种单倍型,其中长兴、双浦、八里店和醴陵群体的单倍型数目分别为5、12、4 和 2;单倍型多样性(h)介于 0.226~0.915 之间,核苷酸多样性(π)介于 0.00640~0.01433 之间。4 个黄尾鲴养殖群体的遗传多样性具有一定差异,不同养殖群体间遗传距离为 0.03782 ~ 0.88756,遗传分化系数为0.78903(P<0.01),群体内变异占整个遗传变异的 21.10%,其中长兴群体和八里店群体的遗传分化系数最低,双浦和醴陵群体的遗传分化系数最高,遗传变异主要发生在群体间。【结论】4 个黄尾鲴养殖群体的遗传多样性具有一定差异。黄尾鲴遗传变异和种群结构的信息可为其遗传多样性变化的研究提供参考,有助于黄尾鲴的资源保护。

关 键 词:黄尾鲴  线粒体  DNA(mtDNA)  D-loop  序列  遗传多样性  遗传结构

Genetic Diversity Analysis of Four Cultured Xenocypris davidi Populations Based on Mitochondrial D-loop Sequences
LIU Shili,CHEN Dawei,ZHENG Jianbo,CHENG Shun,JIANG Wenping,CHI Meili,XIA Fengbo,LI Fei.Genetic Diversity Analysis of Four Cultured Xenocypris davidi Populations Based on Mitochondrial D-loop Sequences[J].Guangdong Agricultural Sciences,2023,50(11):139-145.
Authors:LIU Shili  CHEN Dawei  ZHENG Jianbo  CHENG Shun  JIANG Wenping  CHI Meili  XIA Fengbo  LI Fei
Abstract:
Keywords:Xenocypris davidi  mitochondrial DNA (mtDNA)  D-loop sequence  genetic diversity  genetic structure
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