狗枣猕猴桃AkHSP20基因的生物信息学分析 |
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引用本文: | 刘丹,毕德泷,陈鑫,王立凤.狗枣猕猴桃AkHSP20基因的生物信息学分析[J].贵州农业科学,2019,47(12):87. |
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作者姓名: | 刘丹 毕德泷 陈鑫 王立凤 |
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作者单位: | 牡丹江师范学院,黑龙江牡丹江157012;牡丹江师范学院,黑龙江牡丹江157012;牡丹江师范学院,黑龙江牡丹江157012;牡丹江师范学院,黑龙江牡丹江157012 |
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基金项目: | 黑龙江省教育厅项目(1354MSYYB007);牡丹江师范学院科研项目(QN2019005);黑龙江省教育厅项目(1353PT007);黑龙江省大学生创新创业训练计划项目(201910233007) |
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摘 要: | 为探明狗枣猕猴桃AkHSP20的功能,利用生物信息学工具和方法,对其蛋白质的理化性质、亲水/疏水性、跨膜结构、结构功能域、二级结构、三级结构、蛋白质修饰位点及同源性等进行分析和预测。结果表明:AkHSP20的cDNA全长为922bp,CDS为582bp,编码蛋白是由194个氨基酸构成的亲水性非稳定蛋白,属于HSP20蛋白家族(ID 10157978),主要构件为α-螺旋和不规则卷曲,与其他15种植物的HSP氨基酸序列进行对比,表明其与中华猕猴桃变种亲缘关系较近。
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关 键 词: | 狗枣猕猴桃 AkHSP20 生物信息学 |
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