| 基于转录组测序筛选鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失菌的差异表达基因 |
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| 引用本文： | 杨阳,杨琦,董然然,潘永,李晨,刘丽娟,文明,周碧君,王开功.基于转录组测序筛选鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失菌的差异表达基因[J].畜牧兽医学报,2019,50(12):2578-2584. |
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| 作者姓名： | 杨阳 杨琦 董然然 潘永 李晨 刘丽娟 文明 周碧君 王开功 |
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| 作者单位： | 1. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025;2. 贵州大学动物疫病研究所, 贵阳 550025;3. 贵州省动物疫病研究室, 贵阳 550025;4. 贵州省畜禽资源遗传管理站, 贵阳 550025;5. 贵州都匀市动物疫病预防控制中心, 都匀 558000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31602065）；贵州省科学技术基金（科合LH字[2017]7263；黔科合平台人才[2017]5788；黔科合基础黔科合基础[2016]1047）；贵州大学博士基金项目（贵大人基合字（2015）61号） |
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| 摘 要： | 旨在鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株转录组测序中分析适应环境变化及细菌分泌通路，筛选相关基因。通过使用实时荧光定量PCR对鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株转录组测序结果进行验证，从而对鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株的细菌趋化性通路、细菌双组分通路、细菌分泌通路进行深入分析，筛选相关的重要调控基因。结果显示：在细菌趋化性通路中筛选出yiaD、STM3138、STM3216和malE等4个共表达基因；在细菌分泌通路中筛选出spaP、invA、prgH、invE、spaS、invG和ssaV等7个共表达基因；在细菌双组分通路中筛选出ybfM、htrA、pagO、STM3138、STM3031、ttrB、hilD、pstS、STM1530、hilA、pgtC、hydH、pocR、STM3216、ttrR和fljB等16个共表达基因。在鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株的趋化性通路、细菌双组分通路、细菌分泌通路中筛选出差异表达基因，hfq能够对这些基因进行调控，从而影响如运动性、毒力等相关作用，为沙门菌中的sRNA与hfq后续研究及沙门菌的防治奠定一定基础。
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| 关 键 词： | 沙门菌 沙门菌hfq基因缺失株 sRNA伴侣蛋白Hfq |
| 收稿时间： | 2019-06-27 |
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