| 罗田甜柿Ty1-copia类逆转座子RNaseH-LTR序列的分离和特性分析 |
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| 引用本文： | 杜晓云,张青林,罗正荣.罗田甜柿Ty1-copia类逆转座子RNaseH-LTR序列的分离和特性分析[J].园艺学报,2008,35(4):501-508. |
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| 作者姓名： | 杜晓云 张青林 罗正荣 |
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| 作者单位： | （华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室，武汉430070） |
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| 摘 要： | 逆转座子序列信息的获得，对了解其在基因组中的行为及系统学研究有重要价值。本试验从罗田甜柿（Diospyros kaki Thunb. 'Luotian-tianshi'）基因组中分离31个RNaseH-LTR（Long Terminal Repeat，长末端重复）序列，并利用IRAP（Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism，逆转座子间扩增多态性）技术对部分序列相应的逆转座子家族在柿属植物中的转座活性及分布情况进行初步探讨。序列分析结果表明，至少有10个Ty1-copia类逆转座子家族得到扩增；其家族间普遍表现高度异质，碱基替换、插入或缺失突变，以及翻译成氨基酸后发生不同程度的终止密码子突变、氨基酸取代和移框突变等，是产生高异质性的原因；此外，其家族内部某些序列间的相似性极高，可能是寄主基因组与逆转座子间互惠关系的体现。应用部分逆转座子引物的IRAP分析结果表明，相应的逆转座子家族在柿属植物中普遍存在，其分布广泛，拷贝数高，转座活性强，具有进一步开发为多种逆转座子分子标记的潜力。
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| 关 键 词： | 柿 Ty1-copia逆转座子 抑制PCR 长末端重复 逆转座子间扩增多态性 |
| 收稿时间： | 2007-10-15 |
Isolation and Characterization of RNaseH-LTR Sequences of Ty1-copia Like Retrotransposons in Oriental Persimmon (Diospyros kaki Thunb. 'Luotian-tianshi') |
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| DU Xiao-yun,ZHANG Qing-lin,LUO Zheng-rong.Isolation and Characterization of RNaseH-LTR Sequences of Ty1-copia Like Retrotransposons in Oriental Persimmon (Diospyros kaki Thunb. 'Luotian-tianshi')[J].Acta Horticulturae Sinica,2008,35(4):501-508. |
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| Authors: | DU Xiao-yun ZHANG Qing-lin LUO Zheng-rong |
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| Institution: | (Key Laboratory of Horticultural Plant Biology, MOE，Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Diospyros kaki Thunb Diospyros kaki Thunb copia retrotransposon Ty1-copia retrotransposon suppression PCR long terminal repeat (LTR inter-retrotransposon amplified polymorphism (IRAP |
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