| 基于高通量测序的缢蛏三唑磷急性毒性胁迫下miRNA转录组分析 |
| |
| 引用本文： | 吴越,陈星星,朱洁,周朝生.基于高通量测序的缢蛏三唑磷急性毒性胁迫下miRNA转录组分析[J].浙江农业科学,2023(6):1338-1342. |
| |
| 作者姓名： | 吴越 陈星星 朱洁 周朝生 |
| |
| 作者单位： | 1. 浙江省海洋水产养殖研究所;2. 浙江省近岸水域生物资源开发与保护重点实验室 |
| |
| 摘 要： | 本文通过高通量测序技术分析了三唑磷急性毒性作用下缢蛏miRNA转录组。结果显示，测序数据过滤后的可用序列(clean reads)中长度为21～22 nt的序列占比最高，即大部分序列为微小RNA(miRNA)。所有样品中可以比对到参考序列的reads数占比为65.93%～96.96%,其中大部分注释结果为已知及预测的miRNA。无度量多维标定法(non-metric multi-dimensional scaling, NMDS)结果显示，三唑磷试验组中在24 h采集的样品可聚为一组，而其他样品之间无明显的分组。三唑磷处理24 h后缢蛏中共有123组miRNA表达量出现明显差异，其中上调的有122组，下调的1组，上调的miRNA主要分布于miR-184和miR10家族。处理48 h后miRNA表达量无显著差异。处理72 h后有39组miRNA表达量出现显著差异且均为上调，上调的miRNA主要为miR184家族。
|
| 关 键 词： | 缢蛏 三唑磷 miRNA |
|
|
