中国部分马、驴种质资源CYTB条形码遗传多样性分析 |
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引用本文: | 彭珍珍,张晓婷,郭玛丽,袁朝海,蔡亚非,张威.中国部分马、驴种质资源CYTB条形码遗传多样性分析[J].畜牧与兽医,2023(1):1-7. |
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作者姓名: | 彭珍珍 张晓婷 郭玛丽 袁朝海 蔡亚非 张威 |
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作者单位: | 南京农业大学动物科技学院 |
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基金项目: | 国家重点研发计划(2018YFC1200201); |
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摘 要: | 旨在构建我国部分马、驴细胞色素b(CYTB)基因的DNA条形码数据库,并研究其遗传多样性。以全国不同区域的8个马和3个驴品种共计149例样本为研究对象,以CYTB为候选基因,构建DNA条形码数据库,并与前期获得的细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)和16S rRNA(16S)基因的DNA条形码进行对比,对我国部分马、驴品种进行遗传多样性分析。本研究共生成了CYTB DNA条形码1 271条,经分析,CYTB、COⅠ和16S的GC含量范围分别为44.4%~47.0%、38.3%~47.0%和40.9%~42.6%。对比后发现CYTB基因拥有最多的单倍型序列,在3个基因中表现出更多的多态性位点数,且单倍型多样性更高。编码蛋白的CYTB和COⅠ基因的第3位密码子突变率更高,保守性最小,而非编码蛋白16S基因中3位密码子突变率没有显著差异。CYTB和COⅠ蛋白序列的氨基酸含量不同,CYTB中含量最多的3个氨基酸为亮氨酸、异亮氨酸和苏氨酸,COⅠ为亮氨酸、甘氨酸和丙氨酸。在CYTB和16S条形码中,无论是在物种水平上还是在亚种水平上,种内和种间距离都出现重合现象,而马和驴的COⅠDNA条形码在种内/种间遗...
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关 键 词: | 线粒体DNA DNA条形码 遗传多样性 马 驴 |
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