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| 基于高通量转录组测序的红花籽油对肥育猪肝脏差异表达基因的影响 | |
| 作者单位： | ;1.吉林农业大学动物科学技术学院;2.河南牧业经济学院畜牧工程系;3.吉林大学动物医学学院;4.吉林大学农业试验基地 |
| 摘 要： | 18头肥育猪按饲粮均分为2组,添加红花籽油组和不添加油脂组(对照组)。试验期60d结束,全部屠宰,分别采集肝脏组织样品,进行高通量转录组测序,找出2处理组间的差异表达基因和差异代谢通路。利用Illumina HiSeqTM2500高通量RNA-seq测序技术对2组肥育猪肝脏RNA测序,使用TopHat2软件将测序得到的reads序列与猪(Sscrofa10.2)参考基因组序列比对,找出差异表达基因,在Nr、GO和KEGG数据库中进行功能注释、富集分析和聚类分析。结果显示,红花籽油组和对照组肝脏中差异表达基因共有1 114个,与对照组相比,红花籽油组表达上调的基因有579个,下调的基因有535个。GO功能分类注释到细胞组成、生物学过程和分子功能数据库中的差异表达基因分别有902,903,857个。注释到KEGG通路中差异表达基因414个,显著富集通路4个(P0.05)。 |
| 关 键 词： | 红花籽油 转录组 高通量RNA测序 差异表达基因 代谢通路 肝脏 肥育猪 |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ | |