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猪博卡病毒(重庆株)NP1部分基因的克隆测序及生物信息学分析
作者单位:;1.西南大学动物科技学院;2.四川省广元市动物疫病预防控制中心;3.重庆市出入境检验检疫局
摘    要:通过设计特异性引物建立基于猪博卡病毒(Porcine Bocavivus,PBo V)NP1基因的特异性PCR方法,从重庆地区猪血液中扩增出PBo V-NP1的部分基因片段,进行基因测序,并与Gen Bank公布的PBo V、HBo V及PPV基因序列进行生物信息学分析。结果显示:本次试验克隆得到的PBo V重庆株NP1部分基因片段大小为257 bp,与已公布的PBo V-NP1基因的同源性为97.3%~100%;重庆株与PBo V瑞典株、PBo V中国株属同一进化分支,且PBo V重庆株NP1基因与PBo V瑞典株NP1基因亲缘性非常接近;PBo V重庆株NP1基因与Gen Bank公布的猪PBo V-NP1和1个人HBo V st1聚在博卡病毒一大分支,与PPV分属两大分支,而HBo V st1株又单独形成另一簇。这表明,PBo V重庆毒株与国外毒株的亲缘性非常接近,推测重庆地区猪群中感染的PBo V可能是通过引进或者进口国外动物性产品而传播感染猪群。

关 键 词:猪博卡病毒  NP1基因  克隆  生物信息学

Cloning and Bioinformatics Analysis of Partial NP1 Gene of PBoV Strains from Chongqing
Abstract:
Keywords:
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