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甘蓝型油菜WOX基因家族的鉴定与表达分析
引用本文:陈 玲,王旺田,蒲媛媛,方 彦,武军艳,马 骊,李学才,刘丽君,陈常兵,王积军,孙万仓.甘蓝型油菜WOX基因家族的鉴定与表达分析[J].西北农业学报,2023(8):1173-1186.
作者姓名:陈 玲  王旺田  蒲媛媛  方 彦  武军艳  马 骊  李学才  刘丽君  陈常兵  王积军  孙万仓
作者单位:(甘肃农业大学 农学院,省部共建干旱生境作物学重点实验室,兰州 730070)
基金项目:国家自然科学基金(31860388,31960435);甘肃省科技重大专项(22ZD6NA009);2022年现代丝路寒旱农业科技支撑项目(GSLK-2022-9);国家油菜产业技术体系(GARS-12)。
摘    要:对甘蓝型油菜WOX基因家族进行研究,利用生物信息学方法鉴定到58个家族成员,对其理化性质、系统发育树、基因结构、保守结构域、染色体位置、顺式作用元件和表达模式等进行分析,结果表明:氨基酸长度为121~397,分子质量为13 962.77~44 157.46 u,等电点为5.23~9.63,亲水性均小于0,不稳定系数为42.12~75.63,亚细胞定位在细胞核和叶绿体;系统进化树将WOX基因分为3大类和9个亚支;相同亚支的成员motif和基因结构相似或相同;除 BnWOX1 BnWOX3 BnWOX4 BnWOX15 BnWOX32 BnWOX42 BnWOX43 BnWOX51 BnWOX53 基因外,其余 49 个BnWOX基因不均匀分布在19条染色体中的18条染色体上(ChrC06 除外),有38对串联重复基因;基因上游序列中包含转录因子结合位点、逆境响应、光响应、激素响应、分生组织调控等顺式作用元件等;各组织器官表达分析表明,BnWOX基因在根、茎尖、种子、角果中表达量较高;对WOX基因进行定量分析发现,在冷胁迫和干旱胁迫下基因表达量有显著变化,表明BnWOX基因可能在油菜响应冷/旱胁迫的调控机制中发挥着重要作用。

关 键 词:甘蓝型油菜  WOX家族  系统进化  非生物胁迫

Identification and Expression Analysis of WOX Gene Family in Brassica napus
CHEN Ling,WANG Wangtian,PU Yuanyuan,FANG Yan,WU Junyan,MA Li,LI Xuecai,LIU Lijun,CHEN Changbing,WANG Jijun and SUN Wancang.Identification and Expression Analysis of WOX Gene Family in Brassica napus[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2023(8):1173-1186.
Authors:CHEN Ling  WANG Wangtian  PU Yuanyuan  FANG Yan  WU Junyan  MA Li  LI Xuecai  LIU Lijun  CHEN Changbing  WANG Jijun and SUN Wancang
Abstract:
Keywords:Brassica napus L  WOX gene family  Systematic evolution  Abiotic stress
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