| 红鳍东方鲀SREBP-1基因的电子克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 张伟,付云,张煜.红鳍东方鲀SREBP-1基因的电子克隆及生物信息学分析[J].广东农业科学,2013,40(7):119-123. |
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| 作者姓名： | 张伟 付云 张煜 |
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| 作者单位： | 新乡医学院基础医学院 |
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| 基金项目： | 河南省教育厅重点项目（14A310027）；新乡医学院高学历人才启动基金（505001） |
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| 摘 要： | 利用斑马鱼的SREBP-1 的氨基酸序列NP_001098599.1 为探针，对红鳍东方鲀基因组数据库进行BLAST 分析，获得红鳍东方鲀（Takifugu rubripes）的固醇调节元件结合蛋白-1 （Sterol regulatory element bindingprotein-1，SREBP-1）的cDNA 序列及相应的氨基酸序列。采用生物信息学方法对其基本理化性质、蛋白质结构及功能结构域进行分析。结果发现红鳍东方鲀SREBP-1 基因的开放阅读框全长3 330 bp，共编码1 109 个氨基酸；红鳍东方鲀SREBP-1 的氨基酸序列与黄斑蓝子鱼、大西洋鲑、斑马鱼、人、牛及原鸡的同源性分别为81%、73%、72%、55%、55%、54%和54%；系统进化分析结果表明，红鳍东方鲀SREBP-1 与黄斑蓝子鱼的进化关系最为密切，亲缘关系最近；红鳍东方鲀SREBP-1 蛋白中α-螺旋较多，该蛋白质氨基端包含1 个bHLH-zip 的结构。
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| 关 键 词： | 红鳍东方鲀 固醇调节元件结合蛋白-1 生物信息学 电子克隆 |
Silico cloning and bioinformatic analysis of SREBP-1 gene in torafugu Takifugu rubripes |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Takifugu rubripes SREBP-1 bioinformatics silico cloning |
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