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不同植物黄酮醇合成酶FLS的生物信息学分析
引用本文:黄琼林,蔡春.不同植物黄酮醇合成酶FLS的生物信息学分析[J].广东农业科学,2014,41(13):140-143.
作者姓名:黄琼林  蔡春
作者单位:广东医学院
基金项目:国家自然科学基金(21375029)
摘    要:采用生物信息学方法和工具分析19种不同植物中的黄酮醇合成酶基因的核苷酸序列及编码氨基酸序列,对其理化特性、功能结构域、亲/疏水性、二级结构、信号肽、跨膜结构域以及分子系统进化关系等进行预测和推断,并构建分子进化树。结果表明,不同植物FLS基因的开放阅读框全长在1.0 kb左右,编码蛋白含330余个氨基酸,呈酸性,是一个没有任何信号肽、转运肽和跨膜结构域的亲水性蛋白。不同植物FLS氨基酸序列包含有黄酮醇合成酶功能域,而且琢-螺旋和不规则盘绕是其蛋白质二级结构的最大量结构元件。19个植物FLS在分子进化树中主要聚成3小支,来源于同科植物的FLS首先聚在一起,再与其他物种FLS聚在一起,进化分析在一定程度上反映了这些物种FLS的进化关系。

关 键 词:黄酮醇合成酶  生物信息学  功能分析  结构预测

Bioinformatics analysis of flavonol synthase from various plants
Abstract:
Keywords:flavonol synthase  bioinformatics  functional analysis  structure prediction
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