不同浓度盐胁迫下枸杞实时荧光定量PCR内参基因的筛选 |
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引用本文: | 张得芳,于倩,史文君.不同浓度盐胁迫下枸杞实时荧光定量PCR内参基因的筛选[J].沈阳农业大学学报,2022(5):581-589. |
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作者姓名: | 张得芳 于倩 史文君 |
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作者单位: | 青海大学农林科学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(32170239); |
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摘 要: | 合适的内参基因是实时荧光定量PCR反应准确与否的重要前提。选择茄科植物常用的5个内参基因(GAPDH、Actin、EF1α、UBI、18S)为候选基因,以不同浓度NaCl胁迫后的宁夏枸杞(Lycium barbarum)和黑果枸杞(Lycium ruthenicum)幼苗叶片为试验材料进行qRT-PCR反应,通过GeNorm、Normfinder和BestKeeper软件对这些内参基因的稳定性进行分析排序,从而筛选出最适合枸杞试验研究的内参基因。结果表明:利用GeNorm软件分析荧光定量结果后发现宁夏枸杞和黑果枸杞中都是Actin和GAPDH基因作为内参基因的表达较稳定;NormFinder软件分析结果发现宁夏枸杞中UBI稳定性最好,而在黑果枸杞中Actin基因最稳定;BestKeeper软件分析得出,在宁夏枸杞和黑果枸杞中均为Actin基因的稳定性最好。综合以上结果,在不同浓度的盐胁迫处理条件下,Actin基因的表达稳定性最好,是最适合用于钠离子胁迫下宁夏枸杞、黑果枸杞qRT-PCR分析研究的内参基因,有利于保证后续试验结果的准确性和可靠性。
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关 键 词: | 宁夏枸杞 黑果枸杞 内参基因 qRT-PCR 盐胁迫 |
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