广西三黄鸡PPARγ基因克隆及实时荧光定量PCR的建立 |
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引用本文: | 彭广南,蒋钦杨,王晶,郭亚芬,兰干球,蒋和生.广西三黄鸡PPARγ基因克隆及实时荧光定量PCR的建立[J].南方农业学报,2013,44(8):1377-1381. |
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作者姓名: | 彭广南 蒋钦杨 王晶 郭亚芬 兰干球 蒋和生 |
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作者单位: | 广西大学动物科学技术学院,南宁,530005 |
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基金项目: | 广西科技攻关项目广西大学动物科学技术学院科研发展基金 |
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摘 要: | 目的]克隆广西三黄鸡过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)基因,建立该基因的实时荧光定量PCR,为后续开展广西三黄鸡PPARγ基因组织表达谱及品种间表达差异研究奠定基础.方法]根据GenBank已公布的鸡PPARγ基因序列保守区域,用Oligo 6.0软件设计合成1对引物,以广西三黄鸡脂肪总RNA为模板,用RT-PCR从广西三黄鸡克隆PPARγ基因.以携带PPAR γ基因片段的重组质粒为标准品,建立基于SYBR Green Ⅰ染料法的实时荧光定量PCR标准曲线.结果]广西三黄鸡PPARγ基因的编码区序列(CDS)长1428 bp,编码475个氨基酸;与GenBank已公布的鸡PPARγ基因(AF163811)参考序列比对,其同源性为99.7%,存在4个位点碱基突变,但均为无义突变.广西三黄鸡PPARγ基因的实时荧光定量PCR标准曲线方程为:y=-3.568x+28.50,扩增效率为1.907,实时荧光定量PCR扩增产物的溶解曲线峰单一.结论]鸡PPARγ基因在进化中比较保守;建立的广西三黄鸡PPARγ基因实时荧光定量PCR是可行的.
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关 键 词: | 广西三黄鸡 PPARγ基因 克隆 同源性 实时荧光定量PCR 溶解曲线 |
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