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绵羊IGFBP-6基因的克隆及序列分析
引用本文:周明亮,杨平贵,吴登俊,张翔宇.绵羊IGFBP-6基因的克隆及序列分析[J].河南农业科学,2015(4):144-148.
作者姓名:周明亮  杨平贵  吴登俊  张翔宇
作者单位:1. 四川省草原科学研究院,四川 成都,611743
2. 四川农业大学 动物科技学院,四川 雅安,625014
3. 四川省畜牧科学研究院,四川 成都,610066
基金项目:农业部公益性行业科研专项,四川省畜禽育种攻关项目
摘    要:以凉山半细毛羊为研究对象,克隆了其胰岛素样生长因子结合蛋白6基因(IGFBP-6),采用生物信息学方法进行遗传进化分析,对IGFBP-6蛋白的理化性质进行分析,并对其二级和三级结构进行预测。结果表明,绵羊IGFBP-6基因的CDS全长序列为711 bp,编码236个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为96%、84%、74%,氨基酸序列同源性分别为95%、80%、69%;IGFBP-6蛋白大小为24.9 ku,理论等电点(p I)为8.83。遗传进化分析结果显示,绵羊IGFBP-6基因与山羊、牛等哺乳动物关系较近,与鱼类的亲缘关系较远。IGFBP-6蛋白存在明显的疏水性区域和亲水性区域,有1个信号肽、14个磷酸化位点、3个N-糖基化位点和7个O-糖基化位点;二级结构分析结果显示,IGFBP-6蛋白无规则卷曲、α-螺旋和β-折叠区域比例分别为77.54%、19.92%、2.54%;三级结构分析结果显示,IGFBP-6蛋白存在IGFBP_N和甲状腺球蛋白-Ⅰ型功能域。

关 键 词:绵羊  IGFBP  -  6  基因  克隆  生物信息学

Cloning and Sequence Analysis of IGFBP-6 Gene in Sheep
ZHOU Mingliang , YANG Pinggui , WU Dengjun , ZHANG Xiangyu.Cloning and Sequence Analysis of IGFBP-6 Gene in Sheep[J].Journal of Henan Agricultural Sciences,2015(4):144-148.
Authors:ZHOU Mingliang  YANG Pinggui  WU Dengjun  ZHANG Xiangyu
Abstract:
Keywords:sheep  IGFBP-6 gene  clone  bioinformatics
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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