| 中国南海斑节对虾5个地理群体线粒体18S rRNA基因序列比较分析 |
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| 引用本文： | 周发林,江世贵,姜永杰,黄建华,马之明.中国南海斑节对虾5个地理群体线粒体18S rRNA基因序列比较分析[J].水产学报,2009,33(2):208-214. |
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| 作者姓名： | 周发林 江世贵 姜永杰 黄建华 马之明 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院南海水产研究所,中国水产科学研究院南海水产研究所,中国水产科学研究院南海水产研究所,中国水产科学研究院南海水产研究所,中国水产科学研究院南海水产研究所 |
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| 基金项目： | 863项目（2003AA603120）；广东省科技计划项目（2005B20301001）；农业调整项目（06-05-01B） |
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| 摘 要： | 摘要：本文对中国南海海域5个斑节对虾野生群体（三亚群体（SY）、深圳群体（SZ）、阳江群体（YJ）、湛江群体（ZJ）、北海群体（BH））100个样品的 16SrRNA 序列进行PCR扩增,并对扩增产物进行了测序。用Clustal_X排序软件对测序所得的100个16S rRNA序列进行比对。通过ARLEQUIN软件对所得100个mtDNA16S rRNA序列进行比较分析，共检测出28个变异位点，19种单倍型。三亚、深圳、阳江、湛江以及北海等5个野生群体的核苷酸多样性（π）依次分别为0.00435，0.00586，0.01050，0.01081，0.01168。三亚、深圳、阳江、湛江以及北海等5个野生群体的单倍型多样性（H）依次分别为0.6895, 0.5211, 0.5737, 0.6000, 0.7211。对5个野生群体的16S rRNA序列进行FST分析，结果表明湛江、北海群体分别与三亚、深圳两个群体有显著的遗传差异，其余群体之间的遗传差异不显著。对5个群体进行AMOVA分析，结果表明5个群体间存在显著性遗传差异。对5个群体构建分子系统树，结果表明：三亚和深圳群体之间的亲缘关系最近；北海、湛江群体与三亚、深圳群体的亲缘关系很远。以上结果表明，中国南海海域5个斑节对虾野生群体可以为斑节对虾的选择育种提供两个基础群体：一个是三亚、深圳野生原种基础群体；另一个是湛江和北海野生原种基础群体。
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| 关 键 词： | 16S rRNA、斑节对虾、遗传多样性 |
Assessing genetic diversity and genetic structure of the wild tiger prawn (penaeus monodon) in the coastal waters of South China, based on mitochondrial DNA 16S rRNA sequences |
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| Institution: | South China Sea Fisheries Research Institute,,,, |
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| Keywords: | 16S rRNA Penaeus monodon genetic diversity |
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