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山鸡椒ISSR扩增条件的优化
引用本文:徐兴利,金则新,李钧敏,祈彩虹.山鸡椒ISSR扩增条件的优化[J].江苏农业科学,2011(1).
作者姓名:徐兴利  金则新  李钧敏  祈彩虹
作者单位:1. 西南大学三峡库区生态环境教育部重点实验室,重庆北碚,400715;台州学院生态研究所,浙江临海,317000
2. 台州学院生态研究所,浙江临海,317000
摘    要:采用改进的SDS法提取山鸡椒基因组DNA,利用单因素试验对ISSR反应体系中的Mg<'2+>浓度、dNTP浓度、模板DNA用量、Taq DNA 聚合酶用量、BSA浓度、引物用量进行筛选和优化,得出了适用于山鸡椒ISSR分析的扩增条件:10μl PCR反应体积,1×Taq酶配套缓冲液(200 mmol/L Tris·HCl,pH值8.8,100 mmol/L KCl,1%Triton X-100,100 mmol/L(NH<,4>)<,2>SO<,4>,15 mmol/L MgCl<,2>),0.8 U Taq DNA聚合酶,16 ng模板DNA,6 pmol引物,0.3 mmol/L dNTP,1.75 mmol/L Mg<'2+>.利用优化反应体系从100个ISSR引物中筛选出12个重复性好、稳定性高的引物对21个山鸡椒个体的DNA进行扩增,共得到107个位点,其中,91个为多态位点,多态位点百分率为85.05%,Nei指数为0.361 3,Shannon信息指数为0.522 1,表明山鸡椒的遗传多样性处于较高水平.

关 键 词:山鸡椒  优化  遗传多样性

Optimization of ISSR amplification conditions of Litsea cubeba
Abstract:
Keywords:ISSR
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