| PCK1基因下游82.4kb处的选择信号可能导致其在鸭驯化过程中的表达变化 |
| |
| 引用本文： | 陈黎,刘睿,李国勤,沈军达,卢立志.PCK1基因下游82.4kb处的选择信号可能导致其在鸭驯化过程中的表达变化[J].农业生物技术学报,2016(6):881-888. |
| |
| 作者姓名： | 陈黎 刘睿 李国勤 沈军达 卢立志 |
| |
| 作者单位： | 1. 浙江省农业科学院畜牧兽医研究所,杭州,310021;2. 中国农业大学生物学院,北京,100193 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(No.31402065)、国家“十二五”科技支撑计划项目(No.2012BAD39B00)和国家水禽产业技术体系专项(CARS-43-2) |
| |
| 摘 要： | 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶基因(phosphoenolpyruvate carboxykinase 1(Soluble),PCK1)是糖异生及甘油异生的关键基因.为分析PCK1基因在家鸭(Anas platyrhynchos domesticus)驯化过程中是否出现表达差异以及是否受到驯化选择,本研究分别以绿头野鸭(Anas platyrhynchos)、绍兴鸭及北京鸭作为野生品种、蛋鸭及肉鸭品种代表,检测PCK1基因在这3个品种中的表达水平、杂合度(Hp)以及遗传距离(Fst).表达分析发现,与绿头野鸭相比,PCK1在绍兴鸭及北京鸭肝脏组织中表达量分别下降了3倍、10倍;在脂肪组织中分别下降了3倍、26倍.根据全基因组Z(Hp)及Z(Fst)分布情况,以Z(Hp)＜-3、Z(Fst)＞2作为选择信号筛选标准.按照此标准发现PCK1基因下游82.4 kb处(KB742479.1:2 220 079～2 259 967 bp)出现选择信号.与绿头野鸭相比,该区域在绍兴鸭及北京鸭中杂合度均降低,Z(Hp)值分别为-3.92及-3.63;遗传距离均最大,Z(Fst)值分别为3.91及2.54.对该区域临近基因(ENSAPLG00000002901,C20orf85,PCK1)的表达分析发现,仅PCK1基因在鸭驯化过程中出现表达差异.因此,推测该选择信号可能导致了PCK1基因在家鸭与野鸭间的表达差异.本研究首次较深入的探索了鸭的驯化遗传机制;研究发现鸭驯化过程中PCK1存在表达变化,同时其下游82.4 kb处出现选择信号,这些结果为进一步研究PCK1的功能提供了线索.
|
| 关 键 词： | PCK1基因 杂合度 遗传距离 |
Selection Signals 82.4 kb Downstream from PCK1 Might Induce Differential Expression of PCK1 During Duck (Anas platyrhynchos domesticus) Domestication |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | PCK1 gene Heterozygosity Genetic distance |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
|
