| 半滑舌鳎trim36基因cDNA克隆及表达分析 |
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| 引用本文： | 王文文,朱颖,位战飞,郑卫卫,董忠典,高峰涛,邵长伟,温海深,陈松林.半滑舌鳎trim36基因cDNA克隆及表达分析[J].农业生物技术学报,2016(7):968-979. |
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| 作者姓名： | 王文文 朱颖 位战飞 郑卫卫 董忠典 高峰涛 邵长伟 温海深 陈松林 |
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| 作者单位： | 1. 中国海洋大学水产学院,青岛266003;中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛266071;2. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛,266071;3. 中国海洋大学水产学院,青岛,266003;4. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛266071;海洋科学与技术国家实验室/海洋渔业科学与食物产出功能实验室,青岛266237 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金重点项目(No.31130057)和山东省泰山学者攀登计划专项 |
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| 摘 要： | 三重基序蛋白(the tripartite motif-containing protein,TRIM)家族是一类结构保守、进化快速的E3泛素蛋白连接酶,参与诸多重要的生命过程.TRIM36是TRIM家族的一员,trim36编码E3泛素蛋白连接酶.本研究在已完成的半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)全基因组测序及转录组测序的基础上,利用RACE技术克隆得到半滑舌鳎trim36基因(GenBank登录号:KU244470),序列全长为2 899 bp,其中ORF为2 214 bp,编码737个氨基酸,5’非翻译区(untranslated regions,UTR)为289 bp,3'UTR为396 bp.生物信息学分析显示,半滑舌鳎TRIM36蛋白包含1个锌指结构,2个B-BOX类型锌指蛋白结构域(B-Box-typezinc finger,BBOX),1个卷曲螺旋结构,1个羧基末端的纤连蛋白Ⅲ(fibronectin typeⅢ,FN3)结构域和1个双特异性蛋白激酶spla和兰尼碱受体(spla kinase and ryanodine receptor,SPRY)结构域.此外,在不同脊椎动物中,trim36基因与其邻近的基因具有保守的共线性关系.半定量RT-PCR及qRT-PCR结果显示,在半滑舌鳎不同组织中,trim36基因表达存在差异.trim36在卵巢中表达量最高,其次为雌、雄鱼的脑中;不同发育时期中,trim36基因在120日龄半滑舌鳎性腺中开始表达,且卵巢表达量显著高于精巢(P＜0.05).原位杂交结果显示,trim36基因杂交信号主要出现在Ⅰ期和Ⅱ期卵母细胞.trim36时空表达特征表明,其在卵巢腔的形成及Ⅰ期、Ⅱ期卵母细胞的形成中起重要作用.结果表明,trim36在性别发生方面有一定的作用,这为进一步研究鱼类ttim36基因功能及TRIM家族基因功能提供线索和参考.
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| 关 键 词： | 半滑舌鳎 三重基序蛋白基因(trim36) 克隆 qRT-PCR 原位杂交 |
Cloning and Expression Analysis of trim36 Gene in Half-smooth Tongue Sole (Cynoglossus semilaevis) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Half smooth tongue sole The tripartite motif-containing protein gene (trim36) Cloning qRT-PCR In situ hybridization |
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