| 陆地棉GhSAMDC基因家族的全基因组分析 |
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| 引用本文： | 梁其干,熊显鹏,李艳军,张新宇,孙 杰.陆地棉GhSAMDC基因家族的全基因组分析[J].西北农业学报,2019,28(3):388-396. |
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| 作者姓名： | 梁其干 熊显鹏 李艳军 张新宇 孙 杰 |
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| 作者单位： | （石河子大学 农学院，新疆生产建设兵团绿洲生态农业重点实验室，新疆石河子 832003） |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31301394）;石河子大学动植物育种专项重点项目（YZZX201601）。 |
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| 摘 要： | 以已报道的SAMDC为探针序列,从异源四倍体陆地棉基因组数据库中筛选获得14个GhSAMDC家族基因。GhSAMDC家族基因的氨基酸多重序列比对发现该家族成员序列相似性约为50%,家族成员均具有GhSAMDC家族特有的保守结构域:酶原剪切位点结构域(LSESSLF)和PEST(TIHVTPEDGFSYAS)结构域。染色体定位分析发现14个基因均匀地分布在A和D基因组,A和D上各含7个GhSAMDC成员,无家族成员构成基因簇的现象。转录组测序结果发现 GhSAMDC1、 GhSAMDC7和 GhSAMDC8对黄萎病菌的胁迫有明显的响应,暗示这些在棉花抵御黄萎病菌胁迫过程中发挥一定的作用。试验为进一步研究GhSAMDC家族基因的功能及解析棉花抗黄萎病分子机制奠定了一定基础。
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| 关 键 词： | 陆地棉 SAMDC 基因家族 黄萎病 |
Global Genome Analysis of GhSAMDC Gene Family in Gossypium hirsutum |
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| LIANG Qigan,XIONG Xianpeng,LI Yanjun,ZHANG Xinyu and SUN Jie.Global Genome Analysis of GhSAMDC Gene Family in Gossypium hirsutum[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2019,28(3):388-396. |
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| Authors: | LIANG Qigan XIONG Xianpeng LI Yanjun ZHANG Xinyu and SUN Jie |
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