| 甘蔗ATP结合蛋白基因克隆及其干旱胁迫下的表达特性分析 |
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| 引用本文： | 曹辉庆,蒋胜理,黄诚梅,邓智年,吴凯朝,徐林,罗海斌,陆珍,魏源文.甘蔗ATP结合蛋白基因克隆及其干旱胁迫下的表达特性分析[J].南方农业学报,2017,48(9). |
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| 作者姓名： | 曹辉庆 蒋胜理 黄诚梅 邓智年 吴凯朝 徐林 罗海斌 陆珍 魏源文 |
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| 作者单位： | 1. 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,南宁,530007;2. 广西农业科学院甘蔗研究所/农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室/广西甘蔗遗传改良重点实验室,南宁,530007 |
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| 基金项目： | 广西自然科学基金项目，广西八桂学者专项项目 |
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| 摘 要： | 【目的】克隆甘蔗ATP结合蛋白基因,分析其基本生物学信息及在干旱胁迫下的表达特性,为ATP结合蛋白的功能研究提供理论依据。【方法】从乙烯诱导甘蔗差异表达转录组和水分胁迫下甘蔗cDNA文库中获取ATP结合蛋白基因序列,设计其引物进行RT-PCR扩增,利用生物信息学软件进行序列分析及其蛋白结构和功能预测,并采用实时荧光定量PCR(qPCR)检测干旱胁迫处理下的甘蔗ATP结合蛋白基因的表达情况。【结果】克隆获得的甘蔗ATP结合蛋白基因全长2145 bp,编码714个氨基酸,其蛋白分子质量为79.430 kD,理论等电点(pI)为9.33,不稳定系数为44.38;甘蔗ATP结合蛋白与玉米ATP结合蛋白的核苷酸序列及其推导氨基酸系列同源性最高,均达93%。甘蔗ATP结合蛋白主要由无规则卷曲(42.02%)、α螺旋(25.63%)和延伸链(22.27%)结构组成,具有蛋白激酶催化结构域、ATP结合位点、核苷酸结合位点(NBS)、糖基化位点、激酶磷酸化结合位点及核定位信号等;甘蔗ATP结合蛋白可能主要定位在细胞核、叶绿体、线粒体和过氧化物酶体中,起中间代谢调控作用,或参与转录调控、免疫应答、胁迫应答及信号转导等生物反应。qPCR检测结果显示,在干旱胁迫7 d后,甘蔗ATP结合蛋白基因的表达量明显下调,约为对照的30%,恢复正常供水(复水)后,表达量回升。【结论】甘蔗ATP结合蛋白基因表达受干旱胁迫诱导,可能参与甘蔗对干旱逆境胁迫响应的代谢调控。
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| 关 键 词： | 甘蔗 ATP结合蛋白 基因克隆 生物信息学 干旱胁迫 表达特性 |
Cloning of ATP binding protein gene in sugarcane and its expression characteristics under drought stress |
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| CAO Hui-qing,JIANG Sheng-li,HUANG Cheng-mei,DENG Zhi-nian,WU Kai-chao,XU Lin,LUO Hai-bing,LU Zhen,WEI Yuan-wen.Cloning of ATP binding protein gene in sugarcane and its expression characteristics under drought stress[J].Journal of Southern Agriculture,2017,48(9). |
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| Authors: | CAO Hui-qing JIANG Sheng-li HUANG Cheng-mei DENG Zhi-nian WU Kai-chao XU Lin LUO Hai-bing LU Zhen WEI Yuan-wen |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | sugarcane ATP binding protein gene cloning bioinformatics drought stress expression characteristics |
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