| 上海及新疆地区猪戊型肝炎病毒开放阅读码框架2序列的克隆与分析 |
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| 引用本文： | 张维谊,鞠厚斌,刘健,刘佩红,周锦萍.上海及新疆地区猪戊型肝炎病毒开放阅读码框架2序列的克隆与分析[J].中国兽医寄生虫病,2010,18(4):26-31. |
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| 作者姓名： | 张维谊 鞠厚斌 刘健 刘佩红 周锦萍 |
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| 作者单位： | 上海市动物疫病预防控制中心,上海,201103 |
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| 基金项目： | 上海市科技兴农重点攻关项目 |
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| 摘 要： | 通过已建立的动物戊型肝炎病毒（Hepatitis E virus,HEV）RT-nPCR方法,检测上海地区和新疆地区猪群样品。扩增HEV开放读码框架2（open reading frame 2,ORF2）保守区,产物为507 bp。经克隆、测序,获得20株上海株、3株新疆株序列,采用分子生物学软件与47株已知HEV进行同源性、进化关系分析。结果23株序列从同源性比对和进化关系分析均属HEVⅣ型,上海株间507 bp的核苷酸同源性为94.1%~100.0%,与上海猪源（DQ450072）、日本人源Japan1（AB369690）亲缘关系近;3株新疆株507 bp间的核苷酸同源性为86.1%~98.2%,与新疆猪源China SW1（AY594199）、中国人源T1株（AJ272108）亲缘关系近;上海株与新疆株间的核苷酸同源性为82.6%~100.0%,提示上海株与新疆株间存在差异。23株HEV在时间和地域关系分析,提示不同年份的新疆株存在差异,同年份不同猪场的新疆株进化关系存在差异,不同年份、不同区县的上海株进化关系也存在差异。
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| 关 键 词： | 戊型肝炎病毒 开放读码框架2 序列分析 |
CLONING AND SEQUENCE ANALYSIS OF OPEN READING FRAME 2 OF SWINE HEPATITIS E VIRUSES FROM SHANGHAI AND XINJIANG AREAS |
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| ZHANG Wei-yi,JU Hou-bin,LIU Jian,LIU Pei-hong,ZHOU Jin-ping.CLONING AND SEQUENCE ANALYSIS OF OPEN READING FRAME 2 OF SWINE HEPATITIS E VIRUSES FROM SHANGHAI AND XINJIANG AREAS[J].Chinese Journal of Veterinary Parasitology,2010,18(4):26-31. |
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| Authors: | ZHANG Wei-yi JU Hou-bin LIU Jian LIU Pei-hong ZHOU Jin-ping |
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| Institution: | (Shanghai Animal Disease Control Center,Shanghai 201103,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hepatitis E virus（HEV） open reading frame 2（ORF2） sequence analysis |
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