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与蒙古冰草抗旱相关的NAC转录因子生物信息学及其表达分析
引用本文:范菠菠,张学峰,于卓,赵彦,马艳红.与蒙古冰草抗旱相关的NAC转录因子生物信息学及其表达分析[J].草地学报,2021,29(6):1183-1192.
作者姓名:范菠菠  张学峰  于卓  赵彦  马艳红
作者单位:1. 内蒙古农业大学农学院, 内蒙古 呼和浩特 010019;2. 内蒙古农业大学草原与资源环境学院, 内蒙古 呼和浩特 010018
基金项目:国家自然科学基金(31860670);内蒙古自然科学基金(2018MS03016)资助
摘    要:NAC转录因子具有调控植物生长发育及应对非生物逆境胁迫等多种功能。为筛选蒙古冰草(Agropyron mongolicum Keng)抗旱相关的NAC转录因子,本研究基于转录组测序数据,利用生物信息学方法对蒙古冰草NAC转录因子的结构、理化性质、进化关系和保守性等进行分析,同时运用实时荧光定量技术对抗旱相关的2个NAC基因进行差异表达分析。结果表明:筛选出26个蒙古冰草NAC家族成员,其中15个具有完整NAC转录因子结构域,其均属于亲水性蛋白,大部分定位于细胞核;15个蒙古冰草NAC转录因子的蛋白磷酸化位点均含有丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸。进化关系比对显示AmNAC100和AmNAC102-2转录因子与已知有抗旱功能的NAC蛋白同源性极高,其二、三级结构主要以无规则卷曲为主,motif1,2,3,8为其共有的保守基序,多序列比对将保守结构域划分为子域A—E。差异表达分析发现AmNAC100AmNAC102-2基因相对表达量均高于对照(CK),在蒙古冰草干旱胁迫中起正调控作用。

关 键 词:蒙古冰草  NAC基因家族  抗旱  实时荧光定量  
收稿时间:2021-03-19
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