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云南省猪圆环病毒 2 型遗传进化分析
引用本文:何 帅,章雨竹,吕念词,张以芳,柴 俊.云南省猪圆环病毒 2 型遗传进化分析[J].广东农业科学,2022,49(12):110-117.
作者姓名:何 帅  章雨竹  吕念词  张以芳  柴 俊
作者单位:1. 眉山职业技术学院,云南 眉山 620010;2. 云南农业职业技术学院,云南 昆明 650031;3. 云南农业大学,云南 昆明 650201
基金项目:眉山职业技术学院科研基金(22KY03)
摘    要:【目的】调查猪圆环病毒 2 型(PCV2)在云南猪群和牛群中的流行情况,明确云南 PCV2 毒株的遗传变异、分子进化趋势。【方法】采用 PCR 方法对云南省 11 个地区 783 份猪、牛的血液、粪便等样品进行PCV2 病原学检测,对 6 份 PCV2 阳性样品进行全基因组扩增、克隆与序列测定,利用 DNAStar 软件比对分析全基因和 ORF2 氨基酸序列,使用 MEGA 软件绘制遗传进化树。【结果】检测样品的 PCV2 阳性率为 48.73%;共测得 6 株 PCV2 全基因组序列,其中 5 株为 1 767 bp, 1 株为 1 768 bp;经遗传发育分析可知,有 PCV2a 亚型 2 株、PCV2b 亚型 2 株、PCV2d 亚型 2 株;6 株 PCV2 毒株同源性在 94.6%~99.9% 之间,与 GenBank 数据库中 20 条参考株同源性在 91.4%~99.8% 之间;6 株 PCV2 亚型的 ORF2 都有其典型的氨基酸位点,PCV2a 毒株在第 80(V80L)氨基酸位点突变为与 PCV2(b/d)一致,PCV2b 毒株在 59(R59K)、63(K63R)、190(A190T)等氨基酸位点突变与 PCV2d 一致。【结论】PCV2 在云南猪群中普遍存在,以 PCV2a、PCV2b 和 PCV2d 这 3 个基因亚型共存为主,且 PCV2(a/b)有向 PCV2d 突变的趋势,荷斯坦奶牛尚未感染 PCV2。

关 键 词:PCV2  ORF2  进化  突变  流行  感染

Genetic Evolution Analysis of Porcine Circovirus Type 2 in Yunnan Province
HE Shuai,ZHANG Yuzhu,LYU Nianci,ZHANG Yifang,CHAI Jun.Genetic Evolution Analysis of Porcine Circovirus Type 2 in Yunnan Province[J].Guangdong Agricultural Sciences,2022,49(12):110-117.
Authors:HE Shuai  ZHANG Yuzhu  LYU Nianci  ZHANG Yifang  CHAI Jun
Abstract:
Keywords:PCV2  ORF2  evolution  mutation  prevalence  infection
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