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葡萄UBP基因家族对非生物胁迫的响应及VvUBP基因功能研究
引用本文:郭雁飞,徐涛,陈天池,陈哲,杨杰,龚丽丽,斯昊璇,吴月燕.葡萄UBP基因家族对非生物胁迫的响应及VvUBP基因功能研究[J].核农学报,2024(1):33-45.
作者姓名:郭雁飞  徐涛  陈天池  陈哲  杨杰  龚丽丽  斯昊璇  吴月燕
作者单位:1. 浙江万里学院生物与环境学院;2. 上海海洋大学水产与生命学院
基金项目:浙江省重点研发计划(2021C02053);;浙江省教育厅一般科研项目(Y202250321);
摘    要:泛素特异蛋白酶是一个广泛存在于真核生物中且高度保守的基因家族,通过去泛素化作用调节细胞蛋白的各种生理活动。为了系统探究葡萄UBP基因家族功能,本研究运用生物信息学方法对葡萄UBP基因家族成员进行鉴定与分析,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析VvUBPs基因在不同非生物胁迫下的表达模式。结果表明,VvUBP基因家族包括27个成员,编码序列(CDS)长度为594~4 812 bp,编码氨基酸序列长度为197~1 603 aa。系统进化分析结果显示,UBP基因家族可分为8个亚组(GⅠ~GⅧ)。VvUBPs在茎中的表达水平相对较低,VvUBP27、VvUBP10和VvUBP23分别在卷须、花和叶中表达水平较高。外源茉莉酸甲酯(MeJA)处理可显著诱导VvUBP5、VvUBP12、VvUBP18和VvUBP27等4个基因高表达,外源水杨酸(SA)处理可显著诱导VvUBP5和VvUBP19基因高表达。VvUBP15在盐胁迫浓度0.6%时的表达量增加最明显,VvUBP6在弱光胁迫下表达显著下降以及VvUBP25在高温胁迫6 h时增幅最大。综上,VvUBP基因家族成员能够响应不同的非生物...

关 键 词:葡萄  UBP基因家族  生物信息学  表达分析
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