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应用3种遗传分析方法分析养殖鲤与天然群体的遗传差异
引用本文:许丽花,李巍,吴春琳,董在杰,王成辉.应用3种遗传分析方法分析养殖鲤与天然群体的遗传差异[J].浙江大学学报(农业与生命科学版),2012(4):393-399.
作者姓名:许丽花  李巍  吴春琳  董在杰  王成辉
作者单位:1. 上海海洋大学 农业部水产种质资源与利用重点开放实验室 ,上海 201306
2. 全国水产技术推广站 ,北京 100125
3. 中国水产科学研究院 淡水渔业研究中心/农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室 ,江苏 无锡 214081
基金项目:公益性行业(农业)科研专项资助项目(200903045);教育部新世纪优秀人才支持计划资助项目(NCET-08-0896)
摘    要:应用基于分子标记的主成分分析法、贝叶斯遗传聚类法和遗传重排技术对鲤4个人工选育群体(兴国红鲤、荷包红鲤、玻璃红鲤和建鲤)和2个长江干流天然群体(湖北监利和江苏扬州)的10个微卫星标记结果进行分析,以有效检测人工选育群体间以及选育群体与天然群体间的遗传差异。主成分分析显示,人工选育群体与天然群体存在一定程度的遗传分化,荷包红鲤与天然群体的遗传差异最大,其主成分1(PC1)和主成分2(PC2)解释了总遗传变异的48.23%;在贝叶斯遗传聚类分析中,6个群体的最佳聚类数值为4,即兴国红鲤与2个天然群体聚为一类,玻璃红鲤、荷包红鲤和建鲤3个群体分别单独聚为一类;贝叶斯遗传重排分析显示,6个群体的遗传自排率较高,为81%~100%,玻璃红鲤和荷包红鲤的遗传自排率最高,均为100%。研究结果综合表明:4个人工选育群体与天然群体间存在较明显的遗传差异,而且天然群体已受到人工选育群体的遗传影响;这3种方法能很好地检测鲤人工选育群体间、以及选育群体与天然群体间的遗传差异。

关 键 词:  微卫星标记  主成分分析  贝叶斯遗传聚类分析  贝叶斯遗传重排技术

Genetic differentiation of domesticated and wild common carps detected by three genetic analysis methods
XU Li-hua,LI Wei,WU chun-lin,DONG Zai-jie,WANG Cheng-hui.Genetic differentiation of domesticated and wild common carps detected by three genetic analysis methods[J].Journal of Zhejiang University(Agriculture & Life Sciences),2012(4):393-399.
Authors:XU Li-hua  LI Wei  WU chun-lin  DONG Zai-jie  WANG Cheng-hui
Institution:1 (1.Key Laboratory of Aquatic Genetic Resources and Utilization Certificated by Ministry of Agriculture,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306,China;2.National Fisheries Technical Extension Center,Beijing,100125,China;3.Key Open Laboratory of Genetic Breeding and Aquaculture Biology of Freshwater Fishes,Ministry of Agriculture/ Freshwater Fisheries Research Center,Chinese Academy of Fishery Sciences,Wuxi,Jiangsu 214081,China)
Abstract:
Keywords:
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