橡胶树白粉菌侵染过程转录组学分析 |
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引用本文: | 纪晓贝,梁鹏,刘文波,李潇,陈代朋,李志刚,缪卫国.橡胶树白粉菌侵染过程转录组学分析[J].植物保护学报,2021,48(6):1479-1487. |
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作者姓名: | 纪晓贝 梁鹏 刘文波 李潇 陈代朋 李志刚 缪卫国 |
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作者单位: | 海南大学植物保护学院, 热带农林生物灾害绿色防控教育部重点实验室, 海口 570228 |
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基金项目: | 海南省自然科学基金(320QN197),国家自然科学基金(32001844),海南大学高层次人才科研启动基金(KYQD(ZR)20031) |
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摘 要: | 为明确橡胶树白粉菌Erysiphe quercicola参与致病过程相关基因的表达情况,基于RNA-Seq测序技术对橡胶树白粉菌侵染过程进行转录调控研究,通过对病原菌孢子(0 h)及3个侵染时期(接种1、3和30 d)的转录组进行比较,筛选差异表达基因并对其进行功能注释分析,同时对不同侵染阶段的基因表达趋势进行聚类分析。结果表明,相比于病原菌孢子,3个侵染时期(接种后1、3和30 d)分别有198、458和27个差异表达基因。基因功能富集分析发现氧化还原酶相关基因在侵染1 d阶段显著富集,可能参与病原菌侵染前期对活性氧的防御。基因表达趋势聚类分析显示不同侵染阶段的基因共分为51种表达类型,其中编码候选效应蛋白基因集中分布在侵染1 d后上调表达的6个类型当中。表明橡胶树白粉菌侵染过程相关基因具有明显的功能倾向性和表达趋势特征。
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关 键 词: | 橡胶树白粉菌 转录组 差异表达基因 基因表达趋势聚类 候选效应蛋白 |
收稿时间: | 2021/9/6 0:00:00 |
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