| 白花泡桐丛枝病发生过程中全基因组
DNA甲基化差异分析 |
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| 引用本文： | 赵振利,张靖曼,郑秋莉,杨海波,范国强.白花泡桐丛枝病发生过程中全基因组
DNA甲基化差异分析[J].河南农业大学学报,2020,54(3):400-407. |
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| 作者姓名： | 赵振利 张靖曼 郑秋莉 杨海波 范国强 |
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| 作者单位： | 河南农业大学泡桐研究所,河南 郑州 450000,河南农业大学泡桐研究所,河南 郑州 450000,河南农业大学泡桐研究所,河南 郑州 450000,河南农业大学泡桐研究所,河南 郑州 450000,河南农业大学泡桐研究所,河南 郑州 450000 |
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| 摘 要： | 为探究泡桐丛枝病(Paulownia witches’broom, PaWB)的表观遗传机制,以白花泡桐健康苗(PF)和丛枝病苗(PFI)为材料,采用全基因组甲基化测序(WGBS)技术对白花泡桐丛枝病发生过程中全基因组DNA甲基化进行系统研究。结果表明,白花泡桐体内的DNA甲基化主要有mCG、mCHH和mCHG 3种类型;白花泡桐被植原体侵染后,C位点发生甲基化的比率下降,且发病后CHH的甲基化比率降低而CG和CHG的甲基化比率升高。此外,DNA甲基化主要发生在CG序列;差异甲基化区域(DMR)鉴定研究中共检测到了109 334个DMR,其中白花泡桐患病后高甲基化DMR和低甲基化DMR分别有37 408个和71 926个;通过DNA甲基化和转录组的差异表达基因关联分析,找到了6个与PaWB发生相关的差异甲基化基因(DMG),功能分别涉及到植物防御反应、光合作用、植物病原互作、植物激素信号转导等生物学过程。
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| 关 键 词： | 白花泡桐 泡桐丛枝病 全基因组甲基化测序 DNA甲基化 |
Difference analysis of DNA methylation in the whole genome of Paulownia fortunei during the occurrence of PaWB |
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| ZHAO Zhenli,ZHANG Jingman,ZHENG Qiuli,YANG Haibo,FAN Guoqiang.Difference analysis of DNA methylation in the whole genome of Paulownia fortunei during the occurrence of PaWB[J].Journal of Henan Agricultural University,2020,54(3):400-407. |
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| Authors: | ZHAO Zhenli ZHANG Jingman ZHENG Qiuli YANG Haibo FAN Guoqiang |
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