| 河南地方猪mtDNA D-loop序列遗传多样性
及系统进化分析 |
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| 引用本文： | 李新建,薛亚辉,王明宇,段栋栋,刘贤,乔瑞敏,韩雪蕾,王克君,李秀领.河南地方猪mtDNA D-loop序列遗传多样性
及系统进化分析[J].河南农业大学学报,2020,54(3):452-461. |
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| 作者姓名： | 李新建 薛亚辉 王明宇 段栋栋 刘贤 乔瑞敏 韩雪蕾 王克君 李秀领 |
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| 作者单位： | 河南农业大学牧医工程学院,河南 郑州 450002,河南农业大学牧医工程学院,河南 郑州 450002,河南农业大学牧医工程学院,河南 郑州 450002,河南农业大学牧医工程学院,河南 郑州 450002,河南省畜牧总站,河南 郑州 450002,河南农业大学牧医工程学院,河南 郑州 450002,河南农业大学牧医工程学院,河南 郑州 450002,河南农业大学牧医工程学院,河南 郑州 450002,河南农业大学牧医工程学院,河南 郑州 450002 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划;河南省生猪产业技术体系 |
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| 摘 要： | 为了解河南省地方猪种的遗传资源状况,探究猪种间的亲缘关系,对河南省地方猪种(南阳黑猪、确山黑猪、淮南猪、豫西黑猪)及2个参考猪种(莱芜黑猪、二花脸猪)和野猪共计282个样本的mtDNA D-loop序列进行PCR扩增及序列测定,并结合GenBank中3个国外猪种(杜洛克猪、长白猪、约克夏猪)的38条mtDNA D-loop序列,进行单倍型、遗传多样性、系统发育树、网络分析、歧点分布分析。结果表明,河南省地方猪4个品种共236条序列,定义了32种单倍型,单倍型多样度(Hd)和核苷酸多样度(Pi)分别为0.788～0.854、0.001 56～0.004 55。构建的NJ系统进化树将所有样本分为2个独立分支,一支包含所有河南各猪种和部分约克夏猪,另一支全部为引进猪种,表明河南地方猪和3个国外猪种具有2个明显不同的母系起源。网络中介图和歧点分布显示,在历史驯养过程中,整个河南地方猪群体曾经历过群体扩张事件。说明河南地方猪种具有较为丰富的遗传多样性,且彼此之间有一定的基因交流。
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| 关 键 词： | 河南地方猪 mtDNA D-loop区 遗传多样性 系统进化 |
Genetic diversity and phylogenetic relationships of Henan native pig breeds based on the sequence of mtDNA D-loop region |
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| LI Xinjian,XUE Yahui,WANG Mingyv,DUAN Dongdong,LIU Xian,QIAO Ruimin,HAN Xuelei,WANG Kejun,LI Xiuling.Genetic diversity and phylogenetic relationships of Henan native pig breeds based on the sequence of mtDNA D-loop region[J].Journal of Henan Agricultural University,2020,54(3):452-461. |
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| Authors: | LI Xinjian XUE Yahui WANG Mingyv DUAN Dongdong LIU Xian QIAO Ruimin HAN Xuelei WANG Kejun LI Xiuling |
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