| 猪流行性腹泻病毒SCYA2204株的基因克隆及测序分析 |
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| 引用本文： | 孔晶晶,田珺劼,任玉鹏,陈弟诗,包昕.猪流行性腹泻病毒SCYA2204株的基因克隆及测序分析[J].四川畜牧兽医,2024(1):25-30+32. |
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| 作者姓名： | 孔晶晶 田珺劼 任玉鹏 陈弟诗 包昕 |
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| 作者单位： | 1. 西南民族大学畜牧兽医学院;2. 四川省动物疫病预防控制中心 |
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| 摘 要： | 为了解四川省雅安地区流行的PEDV的基因特征及遗传变异情况，本研究通过病毒RNA提取、RT-PCR、基因克隆及测序等方法获得一株PEDV SCYA2204的基因序列，利用生物信息学分析软件分析其核苷酸序列，并推导氨基酸的变异性和遗传进化特征。结果显示：SCYA2204是G2b亚型毒株，其S基因、ORF3基因、E基因、M基因、N基因与参考毒株的核苷酸序列同源性分别为92.5%～99.2%、96.0%～100%、97.0%～100%、97.4%～99.7%、95.2%～99.9%；由S基因构建的遗传进化树显示SCYA2204与5株四川往年流行毒株聚成一支，亲缘关系密切；与PEDV国内常用疫苗株CV777、AJ1102及四川往年流行毒株相比，SCYA2204 S蛋白存在10处氨基酸连续突变；与CV777和AJ1102比较，S蛋白核心中和表位共有2处氨基酸突变；此外，SCYA2204的S基因发生了重组事件，其主要亲本为G2b亚型的CH/SCXH/2018。上述研究表明，当前在雅安地区流行的PEDV毒株氨基酸序列发生了变异和重组，可能导致抗原性发生改变，影响现有疫苗的保护效力。
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| 关 键 词： | 猪流行性腹泻病毒(PEDV) SCYA2204毒株 基因组 变异性 遗传进化分析 |
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