| 猪肌内脂肪沉积相关基因的筛选及其表达特性分析 |
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| 引用本文： | 杨帅,史明月,李文霞,员佳乐,孙迪,路畅,杨阳,蔡春波,高鹏飞,郭晓红,李步高,曹果清.猪肌内脂肪沉积相关基因的筛选及其表达特性分析[J].中国畜牧兽医,2022,49(5):1651-1661. |
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| 作者姓名： | 杨帅 史明月 李文霞 员佳乐 孙迪 路畅 杨阳 蔡春波 高鹏飞 郭晓红 李步高 曹果清 |
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| 作者单位： | 山西农业大学动物科学学院, 太谷 030801 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31872336）；三晋学者支持计划专项经费资助（2016、2017） |
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| 摘 要： | 【目的】 通过分析马身猪和大白猪背最长肌转录组测序数据，筛选肌内脂肪沉积相关基因，并对其表达特性进行分析。【方法】 采集180日龄马身猪和大白猪背最长肌，采用RNA-Seq技术对其进行转录组测序，筛选差异表达基因并进行GO功能和KEGG通路富集分析;采用GeneCards在线查询基因功能，进一步筛选与肌内脂肪沉积相关的差异基因;采用实时荧光定量PCR技术检测差异基因在2个品种猪不同组织以及肌内脂肪细胞成脂分化过程中的表达变化。【结果】 获得2个品种猪背最长肌差异表达基因共280个，其中128个表达显著上调，152个表达显著下调。GO功能富集分析注释到46个条目，其中生物过程24条，分子功能8条，细胞组分14条。KEGG通路分析显著富集到PPAR信号通路、MAPK信号通路和脂肪细胞因子信号等脂肪沉积相关通路。GeneCards功能查询获得TRAF2、DUSP1、ACOT4、NR4A1、SLC27A6、PLIN5共6个与脂肪沉积相关的基因。实时荧光定量PCR分析表明，马身猪和大白猪背最长肌中NR4A1、DUSP1、PLIN5基因表达量差异显著或极显著(P<0.05;P<0.01)，TRAF2、ACOT4和SLC27A6基因表达量差异不显著(P>0.05)，但表达变化趋势与测序结果一致;马身猪腹部皮下脂肪组织中NR4A1和PLIN5基因表达量极显著高于背部皮下脂肪组织(P<0.01)，而大白猪背部皮下脂肪组织中NR4A1和DUSP1基因表达量极显著高于腹部皮下脂肪组织(P<0.01)，PLIN5基因表达量显著高于腹部皮下脂肪组织(P<0.05)。在背部皮下脂肪组织中，NR4A1、DUSP1和PLIN5基因在大白猪中的表达量极显著高于马身猪(P<0.01);在腹部皮下脂肪组织中，NR4A1和DUSP1基因在大白猪中的表达量显著高于马身猪(P<0.05)，PLIN5基因表达量在2个品种间无显著差异(P>0.05)。体外培养的猪肌内脂肪细胞分析表明，随着成脂天数的增加，NR4A1基因表达量呈下降趋势，DUSP1和PLIN5基因表达量均呈上升趋势。【结论】 本研究获得了NR4A1、DUSP1、PLIN5 3个与猪肌内脂肪沉积相关的候选基因，可为后续进一步探讨猪肌内脂肪沉积调控机制提供一定的参考。
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| 关 键 词： | 马身猪 大白猪 RNA-Seq 差异表达基因 肌内脂肪 |
| 收稿时间： | 2021-12-24 |
Screening and Expression Analysis of Genes Related to Porcine Intramuscular Fat Deposition |
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| YANG Shuai,SHI Mingyue,LI Wenxia,YUN Jiale,SUN Di,LU Chang,YANG Yang,CAI Chunbo,GAO Pengfei,GUO Xiaohong,LI Bugao,CAO Guoqing.Screening and Expression Analysis of Genes Related to Porcine Intramuscular Fat Deposition[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2022,49(5):1651-1661. |
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| Authors: | YANG Shuai SHI Mingyue LI Wenxia YUN Jiale SUN Di LU Chang YANG Yang CAI Chunbo GAO Pengfei GUO Xiaohong LI Bugao CAO Guoqing |
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| Institution: | College of Animal Science, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Mashen pigs Large White pigs RNA-Seq differentially expressed genes intramuscular fat |
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