野生盘羊×巴什拜羊杂交二代尾部脂肪差异表达lncRNA的鉴定与分析 |
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引用本文: | 苏晓慧,何海迎,吐尔逊阿依,牙力坤,王琼,马海玉,刘玲玲,刘武军.野生盘羊×巴什拜羊杂交二代尾部脂肪差异表达lncRNA的鉴定与分析[J].中国畜牧兽医,2022,49(5):1796-1805. |
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作者姓名: | 苏晓慧 何海迎 吐尔逊阿依 牙力坤 王琼 马海玉 刘玲玲 刘武军 |
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作者单位: | 1. 新疆农业大学动物科学学院, 乌鲁木齐 830052;2. 吐鲁番职业技术学院, 吐鲁番 838000 |
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基金项目: | 国家自然科学基金重点项目(U1603232) |
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摘 要: | 【目的】 分析不同脂尾型绵羊尾部脂肪组织中的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的表达谱,探究lncRNA与绵羊尾部脂肪沉积机制的关系,为揭示绵羊尾脂沉积机制提供理论依据。【方法】 选择新疆地方绵羊巴什拜羊(肥尾型)和野生盘羊×巴什拜羊杂交二代(小尾型)作为研究对象,采集2个群体尾部脂肪组织,利用转录组测序技术筛选差异表达lncRNA并预测靶基因,对其进行GO功能和KEGG通路富集分析;利用实时荧光定量PCR技术验证转录组测序的表达结果。【结果】 通过差异表达分析共筛选出728个差异表达lncRNAs,其中270个表达下调,458个表达上调;通过差异表达lncRNA靶基因的GO功能和KEGG通路富集分析,筛选到634个靶基因参与疾病、免疫、蛋白修饰、细胞代谢等相关功能分类,共涉及76条信号通路,部分lncRNA介导的靶基因SCD、GPAM、THRSP、FASN等与绵羊尾部脂肪沉积相关。实时荧光定量PCR与转录组测序结果趋势相同。【结论】 lncRNA在绵羊脂尾进化中对尾部脂肪沉积具有重要的调控作用,为从lncRNA的角度分析绵羊脂肪沉积提供了理论依据。
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关 键 词: | 绵羊 尾部脂肪 脂肪沉积 lncRNA 转录组测序 |
收稿时间: | 2021-11-05 |
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