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2021—2022年我国部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因变异分析
引用本文:王志远,刘博奇,许志颖,徐思佳,邢家宝,张桂红,王衡,孙彦阔.2021—2022年我国部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因变异分析[J].畜牧兽医学报,2023(9):3812-3823.
作者姓名:王志远  刘博奇  许志颖  徐思佳  邢家宝  张桂红  王衡  孙彦阔
作者单位:1. 华南农业大学兽医学院广东省临床重大疾病综合防控重点实验室;2. 岭南现代农业科学与技术广东省实验室茂名分中心;3. 华南农业大学国家生猪种业工程技术研究中心;4. 广东海大畜牧兽医研究院有限公司
基金项目:国家自然科学基金项目(32102704);;财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系;
摘    要:为深入了解我国猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行和遗传变异情况,2021—2022年,本课题组在我国13个省份约50个养殖场收集了117份临床疑似猪繁殖与呼吸综合征患猪样品,针对PRRSV的ORF5基因进行了遗传变异分析。通过实时荧光定量PCR鉴定PRRSV阳性样品和基因型,应用RT-PCR扩增PRRSV ORF5和ORF7基因,将阳性样本进行测序并开展系统发育学分群和GP5氨基酸突变分析。结果显示,共检出PRRSV-2阳性样品48份(总体阳性率约41%),经测序共获取38条ORF5序列和10条ORF7序列。所有ORF5序列间核苷酸相似性为77.1%~99.8%,ORF7序列间核苷酸相似性为83.3%~98.7%。系统发育学分群显示,谱系1占比60%(29/48,28株NADC30-like毒株,1株NADC34-like毒株),谱系3占比25%(12/48),谱系5.1占比5%(2/48),谱系8.7占比10%(5/48)。GP5氨基酸分析表明,信号肽(aa 1—26)、中...

关 键 词:猪繁殖与呼吸综合征病毒  ORF5  系统发育学分析  NADC30  NADC34
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